Comparative multi-locus assessment of modern Asian newts (<i>Cynops</i>, <i>Paramesotriton</i>, and <i>Pachytriton</i>: Salamandridae) in southern China suggests a shared biogeographic history
Notice bibliographique
Résumé
Evolutionary biologists are always interested in deciphering the geographic context of diversification, therefore they introduced the concept of comparative phylogeography, which helps to identify common mechanisms that contribute to shared genetic structures among organisms from the same region. Here, we used multi-locus genetic data along with environmental data to investigate shared phylogeographic patterns among three Asian-endemic newt genera, Cynops, Paramesotriton and Pachytriton, which occurred in montane/submontane streams or ponds in southern China. Our 222 samples from 78 localities covered the entire range of the three genera and represented the largest dataset of this group to date. We reconstructed matrilineal genealogies from two protein-coding, mitochondrial genes, and gene network from two nuclear genes. We also estimated divergence times of major cladogenetic events and used occurrence data to evaluate niche difference and similarity between lineages. Our results revealed a common basal split in all three genera that corresponds to the separation of two geographic terrains of southern China. Those ancient divergence occurred during middle to late Miocene and likely correlate with paleoclimatic fluctuations caused by the uplift of the Qinghai-Xizang (Tibet) Plateau (QTP). Particularly, the strengthening and weakening of Asian summer monsoons during the Miocene may have profoundly impacted southern China and led to repeatedly vicariance in those newts. However, despite differences in realized niches between lineages, there is no evidence for divergence of fundamental niches. Preservation of old newt matriline lineages in mountains of southern China suggests that the region acts as both museums and cradles of speciation. Based on those results, we advocate a multi-pronged protection strategy for newts in the three genera.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».