MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4288693494 · doi:10.1101/2022.07.29.501976

Unexpected higher convergence of human-great ape enteric viromes in central African forest than in a European zoo: A One Health analysis

2022· preprint· en· W4288693494 sur OpenAlexfundno aff
Victor Narat, Maud Salmona, Mamadou Kampo, Thibaut Heyer, Séverine Mercier‐Delarue, Noémie Ranger, Stephanie Rupp, Philippe Ambata, Richard Njouom, François Simon, Jérôme Le Goff, Tamara Giles‐Vernick

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueZoonotic diseases and public health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institute for Advanced ResearchAgence Nationale de la RechercheNational Endowment for the Humanities
Mots-clésHuman viromeBiologyOne HealthHuman healthGorillaEcologyGeographyMetagenomicsZoologyEvolutionary biologyEnvironmental ethicsEnvironmental healthPublic healthMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Human-animal pathogenic transmissions threaten both human and animal health, and the processes catalyzing zoonotic spillover and spillback are complex. Prior field studies offer partial insight into these processes but overlook animal ecologies and human perceptions and practices facilitating human-animal contact. Conducted in Cameroon and a European zoo, this holistic study elucidates these processes, integrating metagenomic, historical, anthropological and great ape ecological analyses, and real-time evaluation of human-great ape contact types and frequencies. Surprisingly, we find more enteric virome sharing between Cameroonian humans and great apes than in the zoo, a virome convergence between Cameroonian humans and gorillas, and adenovirus and enterovirus taxa as most frequently shared between Cameroonian humans and great apes. In addition to physical contact from hunting, meat handling and fecal exposure, overlapping human cultivation and gorilla pillaging in forest gardens explain these unexpected findings. Our multidisciplinary study identifies environmental co-use as a complementary mechanism for viral sharing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetZoonotic diseases and public healthTravaux en français237 207