High Expression of Heat Shock Protein Family D Member 1 Predicts Poor Prognosis of Esophageal Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Background: Heat shock protein family D (Hsp60) member 1 (HSPD1) has been reported as a potential survival-related biomarker in some cancers. However, the correlation between HSPD1 expression with prognosis and clinical features of esophageal cancer (EC) is poorly understood. Our research aimed to explore the clinical and prognostic significance of HSPD1 expression in EC patients. Methods: In our study, HSPD1 expression was detected by immunochemistry in 87 EC tissue specimens and 20 normal cancerous peripheral tissue specimens. Meanwhile, we also analyzed the expression of HSPD1 in EC by The Cancer Genome Atlas (TCGA) database. Then Chi-squared and Fisher's exact tests and Wilcoxon signed-rank test and logistic regression models were separately used to test the correlation between clinical characteristics and HSPD1 expression in our and TCGA cohort. Moreover, we evaluated the value of HSPD1 in prognosis by Kaplan-Meier curves and Cox analysis. Finally, gene set enrichment analysis (GSEA) was performed using the data accessed from TCGA. Results: The results showed that HSPD1 was overexpressed in EC, and the expression was related to histological type, histological grade, N classification, and clinical stage. Moreover, Kaplan-Meier curves and Cox analysis indicated that high expression of HSPD1 correlated with poor prognosis, and HSPD1 was an independent risk factor for EC. GSEA identified pathways involved in cysteine and methionine metabolism, spliceosome, selenoamino acid metabolism, mismatch repair, RNA degration, DNA replication, and cell cycle as differentially enriched in ECs with high HSPD1 expression. Conclusions: Our results suggest that HSPD1 is expressed at high levels in EC, and has potential to be used as a novel biomarker for the prognosis of patients with EC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».