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Enregistrement W4288766328 · doi:10.26443/msurj.v17i1.182

Evaluation of Whole Cell Biosensors for Usability in On-site Detection of Two Major Classes of Antibiotics in Agricultural Soil and Water

2022· article· en· W4288766328 sur OpenAlexaff
Jennifer Jiang, Yun Xiao

Notice bibliographique

RevueMcGill Science Undergraduate Research Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntibioticsBiosensorAntibiotic resistanceAgricultureCiprofloxacinBiotechnologyEnvironmental scienceBiologyMicrobiologyNanotechnologyEcologyMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human health is heavily influenced by the environment. In recent years, the contamination of soil and water by antibiotics has become a major public health issue. This is because of the selective pressure from antibiotics in the environment that results in the proliferation of antibiotic-resistant bacteria. A major contributor to the emergence of antibiotic resistance is the indiscriminate use of antibiotics in the agriculture and medical industry, followed by insufficient antibiotic-removal treatment of wastewater from these industries, resulting in the antibiotic accumulation in the environment. Limiting the use of antibiotics must be followed by extensive surveillance to track antibiotic residue levels in agricultural soil and water samples. In recent years, there has been a growing interest in the use of whole cell biosensors to monitor levels of antibiotics in agricultural samples; this is because whole cell biosensors are portable, cheaper, and simpler to operate and interpret compared to traditional methods of antibiotic detection. This review article compares the potential of existing β-lactam and tetracycline whole cell biosensors for on-site analysis of agricultural soil and water samples based on practicality, performance, robustness, and range of detection. Despite the lack of data regarding the performance of these biosensors under varying pH and temperature conditions, this review weighs the benefits and drawbacks of each biosensor to determine a promising candidate for use in on-site detection of β-lactams and tetracyclines. Of the β-lactam biosensors examined, only a Bacillus subtilis-based biosensor was able to detect β-lactams in water samples with high sensitivity and specificity while producing a strong and stable signal. However, this biosensor was not tested in soil samples, has a relatively long response time, and requires a spectrophotometer to view the signal. Engineering the reporter gene to produce a colorimetric signal will increase its potential in on-site detection. Of the tetracycline biosensors examined, a compact paper strip biosensor was found to be sensitive and highly practical when tested in both soil and water samples. Thus, we determined it to be the best candidate for on-site detection. This biosensor, however, also suffers from relatively lengthy response times. The realization of these biosensors as tools for antibiotic surveillance depends on further experimentation using on-site samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,292

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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