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Enregistrement W4288796553 · doi:10.26443/msurj.v15i1.12

Comparison of Complexity and Predictability of a Cellular Automaton Model in Excitable Media Cardiac Wave Propagation Compared with a FitzHugh-Nagumo Model

2020· article· en· W4288796553 sur OpenAlexafffund
Yujing Zou, Gil Bub

Notice bibliographique

RevueMcGill Science Undergraduate Research Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueCellular Automata and Applications
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesMcGill UniversityNational Science Foundation
Mots-clésCellular automatonExcitable mediumPhysicsPredictabilityPlanarSpiral waveStatistical physicsAlgorithmMechanicsMathematicsComputer scienceMathematical analysisSpiral (railway)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Excitable media are spatially distributed systems that propagate signals without damping. Examples include fire propagating through a forest, the Belousov-Zhabotinsky reaction, and cardiac tissue. (1) Excitable media generate waves which synchronize cardiac muscle contraction with each heartbeat. Spatiotemporal patterns formed by excitation waves distinguish healthy heart tissues from diseased ones. (3) Discrete Greenberg-Hastings Cellular- Automaton (CA) (1) and the continuous FitzHugh- Nagumo (FHN) model (7) are two methods used to simulate cardiac wave propagation. However, previous observations have shown that these models are not accurately predictive of experimental results as a function of time. We hypothesize that cardiac simulations deviate from the experimental data at a rate that depends on the complexity of the experimental data’s initial conditions (I.C.).Methods: To test this hypothesis, we investigated two types of propagating waves with different complexities: a planar (i.e. simple) and a spiral wave (i.e. complex). With the same I.C., we first compared simulation results of a Greenberg-Hastings Cellular Automaton (GH-CA) model to that a FitzHugh-Nagumo (FHN) continuous model which we used as a surrogate for experimental data. We then used median-filtered real-time cardiac tissue experimental data to initialize the GH-CA model and observe the divergence of wave propagation in the simulation and the experiment.Results: The alignment between the CA model of a planar wave and the FHN model remains constant, while the degree of overlap between the CA and FHN models decreases for a spiral wave as a function of time. CA simulation initialized by a planar wave real-time cardiac tissue data propagates like the experimental data, however, this is not the case for the spiral wave experimental data.Conclusion: We were able to confirm our hypothesis that the divergence between the two models is due to initial condition (I.C.) complexity.Discussion: We discuss a promising strategy to represent a GH-CA model as a Convolutional Neural Network (CNN) to enhance predictability of the model when an initial condition is given by the experimental data with a higher level of complexity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,730
Score d'incertitude au seuil0,644

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,182
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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