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Enregistrement W4289261376 · doi:10.1136/bmjopen-2021-057649

<i>Strongyloides stercoralis</i> prevalence in solid-organ and haematopoietic stem cell transplant candidates and recipients: a systematic review and meta-analysis protocol

2022· review· en· W4289261376 sur OpenAlexaff
Sapha Barkati, Faheel Naeem, Lindsay Hales, Curtis Quan, Michael Libman

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2022
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasites and Host Interactions
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStrongyloides stercoralisStrongyloidiasisMedicineStrongyloidesPopulationIntensive care medicineSystematic reviewTransplantationInternal medicineImmunologyMEDLINEEnvironmental healthHelminths

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Strongyloides stercoralis is an intestinal helminth ubiquitous in tropical and subtropical regions worldwide. It persists in the human host for a lifetime as a result of autoinfection and if undetected and untreated, can lead to increased morbidity and high mortality in immunocompromised individuals such as the transplant population. Transplant patients, including solid-organ and haematopoietic stem cell transplants (SOT and HSCT, respectively), are at a high risk of hyperinfection and disseminated strongyloidiasis. Unfortunately screening is often not systematically performed. Prevalence estimates of Strongyloides in this high-risk population is not well studied. Through this systematic review, we aim to summarise the descriptive evidence on Strongyloides prevalence in SOT and HSCT patients, including diagnostic and screening practices alongside the cases of hyperinfection, disseminated strongyloidiasis and the mortality rate in this population. Methods and analyses Through the use of various online library databases, we will conduct a systematic review including relevant literature on the prevalence of Strongyloides in SOT and HSCT patients as well as studies assessing hyperinfection and disseminated strongyloidiasis in this patient population. The Population, Intervention, Comparison, Outcome and Study Design strategy and the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses guidelines will be used to determine a final subset of studies for analysis. Quality assessment for case series and case reports will be determined by a modified quality assessment tool developed by the National Heart, Lung, and Blood Institute (NIH), and the CARE guidelines, respectively. We will provide a narrative synthesis of the findings pertaining to the primary and secondary outcomes of interest (prevalence of Strongyloides and mortality rate in transplant population, respectively) alongside the associated 95% CI. Estimates from individual studies will be pooled using a random effects model. Ethics and dissemination This systematic review does not require formal ethical approval since no primary data will be collected. Findings will be disseminated through a peer-reviewed publication and relevant conferences. PROSPERO registration number CRD42021269305.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,027
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,050
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,144

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0270,050
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0210,026
Bibliométrie0,0120,009
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0040,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0340,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,143
Tête enseignante GPT0,447
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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