Towards single cell ICP-MS normalized quantitative experiments using certified selenized yeast
Notice bibliographique
Résumé
In the search for a normalized procedure to replicate and compare single cell-inductively coupled plasma-mass spectrometry (SC-ICP-MS) experiments, SELM-1, a certified reference material containing selenium enriched yeast cells has been used. Selenium concentrations (both, intra- and extracellular) have been measured using either sequential or simultaneous procedures. Regarding quantitative results, the sequential procedure involving cell washing followed by freeze drying of the washed material and intracellular Se quantification using SC-ICP-MS provided best results. In this case, intracellular Se accounted for 1304 ± 48 mg kg−1 (corresponding to 64% of the certified Se content). The average mass of Se per yeast cell was 41.6 fg Se with a dispersion of 1.6–279 fg Se/cell. In the isolated extracellular Se fraction, the Se concentration accounted for 412 ± 48 mg kg−1 (about 21% of the total Se). Thus, the sequential procedure provided a total Se recovery of about 85% with respect to the certified value. The direct dilution and simultaneous measurement of intra- and extracellular Se by SC-ICP-MS provided results of 1024 ± 42 mg kg−1 for intracellular and 316 ± 30 mg kg−1 for extracellular Se representing a total recovery of about 66%. In both cases, an initial thorough characterization of the cell density per solid weighed material was conducted by flow cytometry and the cell integrity ensured using confocal microscopy. These results clearly demonstrated that with appropriate sample preparation, SC-ICP-MS is a unique tool, which is capable of providing quantitative information about intracellular and extracellular Se. In addition, SELM-1 seems the ideal tool to enable data normalization at the single cell level to replicate, benchmark, and improve new SC-ICP-MS studies by using the same material for data validation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».