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Enregistrement W4289336079 · doi:10.1136/bmjopen-2021-055672

Global prevalence of non-tuberculous mycobacteria in adults with non-cystic fibrosis bronchiectasis 2006–2021: a systematic review and meta-analysis

2022· review· en· W4289336079 sur OpenAlexaff
Yunchun Zhou, Wei Mu, Jihua Zhang, Shi Wu Wen, Smita Pakhalé

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBronchiectasisMeta-analysisCochrane LibrarySystematic reviewMEDLINEStudy heterogeneityPublication biasInternal medicinePediatricsLung

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective To accurately estimate the global prevalence of non-tuberculous mycobacteria (NTM) in adults with non-cystic fibrosis (non-CF) bronchiectasis and to determine the proportion of NTM species and subspecies in clinical patients from 2006 to 2021. Design Systematic review and meta-analysis using the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses guidelines. Data sources Medline, Embase, Cochrane Library and Web of Science were searched for articles published between 2006 and 2021. Eligibility criteria for selecting studies We included all the prospective or retrospective studies without language restrictions and all patients were adults (≥18 years of age) with non-CF bronchiectasis. The studies estimated the effect size of the prevalence of NTM with a sample size ≥40, and patients were registered in and after 2006. Data extraction and synthesis Two reviewers screened the titles, abstracts and full texts independently. Relevant information was extracted and curated into tables. Risk of bias was evaluated following the Cochrane Collaboration’s tool. Meta-analysis was performed with software R Statistics V.3.6.3 using random effect model with 95% CI. I 2 index and Q statistics were calculated to assess the heterogeneity, and mixed-effects meta-regression analyses were performed to identify the sources of heterogeneity. The proportions of NTM subspecies were examined using Shapiro-Wilk normality test in R. Results Of all the 2014 studies yielded, 24 met the inclusion criteria. Of these, 14 were identified to be randomised controlled studies and included for an accurate estimation. The global prevalence of NTM in adults with non-CF bronchiectasis from 2006 to 2021 was estimated to be approximately 10%, with great variations primarily due to geographical location. Mycobacterium avium complex was the most common subspecies, followed by Mycobacterium simiae and Mycobacterium gordonae . Conclusions The prevalence of NTM in adults with non-CF bronchiectasis has been on the rise and the most common subspecies changed greatly in recent years. More cohort studies should be done in many countries and regions for future estimates. PROSPERO registration number CRD42020168473.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Méta-épidémiologie (sens large), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,634
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0160,002
Bibliométrie0,0010,004
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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