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Enregistrement W4289745675 · doi:10.1016/j.mri.2022.07.016

Assessment of perivascular space filtering methods using a three-dimensional computational model

2022· article· en· W4289745675 sur OpenAlexafffund
José Bernal, María Valdés Hernández, Javier Escudero, Roberto Duarte, Lucia Ballerini, Mark E. Bastin, Ian J. Deary, Michael J. Thrippleton, Rhian M. Touyz, Joanna M. Wardlaw

Notice bibliographique

RevueMagnetic Resonance Imaging · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCerebrospinal fluid and hydrocephalus
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilUK Dementia Research InstituteAlzheimer’s Research UKFondation LeducqAge UKAlzheimer's SocietyWeston Brain InstituteBritish Heart FoundationMrs Gladys Row Fogo Charitable Trust
Mots-clésComputer scienceVoxelArtificial intelligenceSegmentationMagnetic resonance imagingPattern recognition (psychology)MedicineComputer visionRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Growing interest surrounds the assessment of perivascular spaces (PVS) on magnetic resonance imaging (MRI) and their validation as a clinical biomarker of adverse brain health. Nonetheless, the limits of validity of current state-of-the-art segmentation methods are still unclear. Here, we propose an open-source three-dimensional computational framework comprising 3D digital reference objects and evaluate the performance of three PVS filtering methods under various spatiotemporal imaging considerations (including sampling, motion artefacts, and Rician noise). Specifically, we study the performance of the Frangi, Jerman and RORPO filters in enhancing PVS-like structures to facilitate segmentation. Our findings were three-fold. First, as long as voxels are isotropic, RORPO outperforms the other two filters, regardless of imaging quality. Unlike the Frangi and Jerman filters, RORPO's performance does not deteriorate as PVS volume increases. Second, the performance of all "vesselness" filters is heavily influenced by imaging quality, with sampling and motion artefacts being the most damaging for these types of analyses. Third, none of the filters can distinguish PVS from other hyperintense structures (e.g. white matter hyperintensities, stroke lesions, or lacunes) effectively, the area under precision-recall curve dropped substantially (Frangi: from 94.21 [IQR 91.60, 96.16] to 43.76 [IQR 25.19, 63.38]; Jerman: from 94.51 [IQR 91.90, 95.37] to 58.00 [IQR 35.68, 64.87]; RORPO: from 98.72 [IQR 95.37, 98.96] to 71.87 [IQR 57.21, 76.63] without and with other hyperintense structures, respectively). The use of our computational model enables comparing segmentation methods and identifying their advantages and disadvantages, thereby providing means for testing and optimising pipelines for ongoing and future studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,368
Score d'incertitude au seuil0,804

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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