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Enregistrement W4289783436 · doi:10.1038/s41467-022-32174-7

The molecular mechanism of snake short-chain α-neurotoxin binding to muscle-type nicotinic acetylcholine receptors

2022· article· en· W4289783436 sur OpenAlexaff
Mieke Nys, Eleftherios Zarkadas, Marijke Brams, Aujan Mehregan, Kumiko Kambara, Jeroen Kool, Nicholas R. Casewell, Daniel Bertrand, John E. Baenziger, Hugues Nury, Chris Ulens

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVenomous Animal Envenomation and Studies
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesVlaamse regeringCentre National de la Recherche ScientifiqueVlaams Instituut voor BiotechnologieFrench Infrastructure for Integrated Structural BiologyKU LeuvenFondation pour la Recherche MédicaleAgence Nationale de la RechercheFonds Wetenschappelijk OnderzoekInfrastructures en Biologie Santé et AgronomieWellcome Trust
Mots-clésNicotinic agonistAcetylcholine receptorNeurotoxinReceptorTorpedoNeuromuscular junctionNicotinic acetylcholine receptorProtein subunitBiologyCys-loop receptorsSnake venomBungarotoxinCell biologyVenomNeuroscienceBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bites by elapid snakes (e.g. cobras) can result in life-threatening paralysis caused by venom neurotoxins blocking neuromuscular nicotinic acetylcholine receptors. Here, we determine the cryo-EM structure of the muscle-type Torpedo receptor in complex with ScNtx, a recombinant short-chain α-neurotoxin. ScNtx is pinched between loop C on the principal subunit and a unique hairpin in loop F on the complementary subunit, thereby blocking access to the neurotransmitter binding site. ScNtx adopts a binding mode that is tilted toward the complementary subunit, forming a wider network of interactions than those seen in the long-chain α-Bungarotoxin complex. Certain mutations in ScNtx at the toxin-receptor interface eliminate inhibition of neuronal α7 nAChRs, but not of human muscle-type receptors. These observations explain why ScNtx binds more tightly to muscle-type receptors than neuronal receptors. Together, these data offer a framework for understanding subtype-specific actions of short-chain α-neurotoxins and inspire strategies for design of new snake antivenoms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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