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Enregistrement W4290673092 · doi:10.3174/ajnr.a7591

Stable and Discriminatory Radiomic Features from the Tumor and Its Habitat Associated with Progression-Free Survival in Glioblastoma: A Multi-Institutional Study

2022· article· en· W4290673092 sur OpenAlexaff
Ruchika Verma, Virginia Hill, Volodymyr Statsevych, Kaustav Bera, Ramón Correa, Patrick Leo, Manmeet S. Ahluwalia, Anant Madabhushi, Pallavi Tiwari

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Neuroradiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensNorthern Alberta Institute of Technology
Organismes subventionnairesDOD Peer Reviewed Cancer Research ProgramNational Center for Research ResourcesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringPharmacyclicsNational Institutes of HealthApollomicsVoyager TherapeuticsIncyteU.S. Department of Veterans AffairsVarian Medical SystemsAstraZenecaBristol-Myers SquibbV Foundation for Cancer ResearchDana FoundationWallace H. Coulter FoundationViewRayU.S. Department of DefenseNovocureNational Cancer InstituteCase Western Reserve UniversityNational Science Foundation
Mots-clésMedicineFluid-attenuated inversion recoveryGlioblastomaHyperintensityMagnetic resonance imagingBrain tumorRadiologySurvival analysisRadiomicsNuclear medicinePathologyInternal medicineCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: Glioblastoma is an aggressive brain tumor, with no validated prognostic biomarkers for survival before surgical resection. Although recent approaches have demonstrated the prognostic ability of tumor habitat (constituting necrotic core, enhancing lesion, T2/FLAIR hyperintensity subcompartments) derived radiomic features for glioblastoma survival on treatment-naive MR imaging scans, radiomic features are known to be sensitive to MR imaging acquisitions across sites and scanners. In this study, we sought to identify the radiomic features that are both stable across sites and discriminatory of poor and improved progression-free survival in glioblastoma tumors. MATERIALS AND METHODS: We used 150 treatment-naive glioblastoma MR imaging scans (Gadolinium-T1w, T2w, FLAIR) obtained from 5 sites. For every tumor subcompartment (enhancing tumor, peritumoral FLAIR-hyperintensities, necrosis), a total of 316 three-dimensional radiomic features were extracted. The training cohort constituted studies from 4 sites ( n = 93) to select the most stable and discriminatory radiomic features for every tumor subcompartment. These features were used on a hold-out cohort ( n = 57) to evaluate their ability to discriminate patients with poor survival from those with improved survival. RESULTS: Incorporating the most stable and discriminatory features within a linear discriminant analysis classifier yielded areas under the curve of 0.71, 0.73, and 0.76 on the test set for distinguishing poor and improved survival compared with discriminatory features alone (areas under the curve of 0.65, 0.54, 0.62) from the necrotic core, enhancing tumor, and peritumoral T2/FLAIR hyperintensity, respectively. CONCLUSIONS: Incorporating stable and discriminatory radiomic features extracted from tumors and associated habitats across multisite MR imaging sequences may yield robust prognostic classifiers of patient survival in glioblastoma tumors. AUC : area under the curve CoLlAGe : Co-occurrence of Local Anisotropic Gradient Orientations GBM : Glioblastoma Gd : Gadolinium LOSO : leave-one-site-out PI : preparation-induced instability PFS : progression-free survival T̂ : training set TCIA : The Cancer Imaging Archive VS : validation set TS : test set

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,489

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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