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Enregistrement W4290725887 · doi:10.32614/rj-2022-022

Power and Sample Size for Longitudinal Models in R -- The longpower Package and Shiny App

2022· article· en· W4290725887 sur OpenAlexfundno aff
Samuel Iddi, Michael Donohue

Notice bibliographique

RevueThe R Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueMental Health Research Topics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchWeston Brain InstituteNorthern California Institute for Research and EducationPfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaEli Lilly and CompanyU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationBristol-Myers SquibbNational Institute on AgingAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésSample size determinationComputer scienceNeuroimagingStatistical powerAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeSample (material)R packageClinical study designLongitudinal studyLongitudinal dataClinical trialData scienceMedical physicsData miningAlzheimer's diseaseStatisticsPsychologyMedicineDiseaseMathematicsPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Longitudinal studies are ubiquitous in medical and clinical research. Sample size computations are critical to ensure that these studies are sufficiently powered to provide reliable and valid inferences. There are several methodologies for calculating sample sizes for longitudinal studies that depend on many considerations including the study design features, outcome type and distribution, and proposed analytical methods. We briefly review the literature and describe sample size formulas for continuous longitudinal data. We then apply the methods using example studies comparing treatment versus control groups in randomized trials assessing treatment effect on clinical outcomes. We also introduce a Shiny app that we developed to assist researchers with obtaining required sample sizes for longitudinal studies by allowing users to enter required pilot estimates. For Alzheimer's studies, the app can estimate required pilot parameters using data from the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI). Illustrative examples are used to demonstrate how the package and app can be used to generate sample size and power curves. The package and app are designed to help researchers easily assess the operating characteristics of study designs for Alzheimer's clinical trials and other research studies with longitudinal continuous outcomes. Data used in preparation of this article were obtained from the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) database (adni.loni.usc.edu).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,052
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,279
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,160
Score d'incertitude au seuil0,535

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0520,279
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,005
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,005
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0030,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1600,049

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,411
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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