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Enregistrement W4290729276 · doi:10.3389/fmicb.2022.945498

Pyoluteorin and 2,4-diacetylphloroglucinol are major contributors to Pseudomonas protegens Pf-5 biocontrol against Botrytis cinerea in cannabis

2022· article· en· W4290729276 sur OpenAlexafffund
Carole Balthazar, Renée St-Onge, Geneviève Léger, Simon G. Lamarre, David L. Joly, Martin Filion

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesGenome AtlanticGenome CanadaMitacsSimon Fraser UniversityNew Brunswick Innovation FoundationUniversité de Moncton
Mots-clésBotrytis cinereaPseudomonas fluorescensBiologyBiological pest controlMicrobiologyBotrytisPseudomonasAntagonismPseudomonadalesPseudomonadaceaeBotanyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas protegensPf-5 is an effective biocontrol agent that protects many crops against pathogens, including the fungal pathogenBotrytis cinereacausing gray mold disease inCannabis sativacrops. Previous studies have demonstrated the important role of antibiotics pyoluteorin (PLT) and 2,4-diacetylphloroglucinol (DAPG) in Pf-5-mediated biocontrol. To assess the potential involvement of PLT and DAPG in the biocontrol exerted by Pf-5 againstB. cinereain the phyllosphere ofC. sativa, two knockout Pf-5 mutants were generated by in-frame deletion of genespltDorphlA, required for the synthesis of PLT or DAPG respectively, using a two-step allelic exchange method. Additionally, two complemented mutants were constructed by introducing a multicopy plasmid carrying the deleted gene into each deletion mutant.In vitroconfrontation assays revealed that deletion mutant ∆pltDinhibitedB. cinereagrowth significantly less than wild-type Pf-5, supporting antifungal activity of PLT. However, deletion mutant ∆phlAinhibited mycelial growth significantly more than the wild-type, hypothetically due to a co-regulation of PLT and DAPG biosynthesis pathways. Both complemented mutants recoveredin vitroinhibition levels similar to that of the wild-type. In subsequent growth chamber inoculation trials, characterization of gray mold disease symptoms on infected cannabis plants revealed that both ∆pltDand ∆phlAsignificantly lost a part of their biocontrol capabilities, achieving only 10 and 19% disease reduction respectively, compared to 40% achieved by inoculation with the wild-type. Finally, both complemented mutants recovered biocontrol capabilitiesin plantasimilar to that of the wild-type. These results indicate that intact biosynthesis pathways for production of PLT and DAPG are required for the optimal antagonistic activity ofP. protegensPf-5 againstB. cinereain the cannabis phyllosphere.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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