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Enregistrement W4290731932 · doi:10.1016/j.jiac.2022.08.002

Inferring the true number of SARS-CoV-2 infections in Japan

2022· review· en· W4290731932 sur OpenAlexaff
Lauren McKenzie, Affan Shoukat, K. Wong, Koju Itahashi, Eiji Yasuda, Alex Demarsh, Kamran Khan

Notice bibliographique

RevueJournal of Infection and Chemotherapy · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalUniversity of TorontoYork UniversityBlueDot (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)PandemicEpidemiologySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)SeroprevalenceDemographyCase fatality ratePopulationSubclinical infection2019-20 coronavirus outbreakVaccinationOutbreakEnvironmental healthVirologyImmunologyInfectious disease (medical specialty)Internal medicineDiseaseSerology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: In Japan, as of December 31, 2021, more than 1.73 million laboratory-confirmed cases have been reported. However, the actual number of infections is likely to be under-ascertained due to the epidemiological characteristics such as mild and subclinical infections and limited testing availability in the early days of the pandemic. In this study, we infer the true number of infections in Japan between January 16, 2020, and December 31, 2021, using a statistical modelling framework that combines data on reported cases and fatalities. METHODS: We used reported COVID-19 deaths and age-specific infection fatality ratios (IFR) to impute the true number of infections. Estimates of IFR were informed from published studies and were adjusted to reflect the effects of pharmaceutical interventions, mass vaccination, and evolving variants. To account for the uncertainty in IFR, we sampled values from relevant distributions. RESULTS: We estimated that as of December 31, 2021, 3.07 million (CrI: 2.05-4.24 million) people had been infected in Japan, which is 1.77 times higher than the 1.73 million reported cases. Our meta-analysis confirmed that these findings were consistent with the intermittent seroprevalence studies conducted in Japan. CONCLUSIONS: We have estimated that a substantial number of COVID-19 infections in Japan were unreported, particularly in adults. Our approach provides a more realistic assessment of the true underlying burden of COVID-19. The results of this study can be used as fundamental components to strengthen population health control and surveillance measures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil0,610

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,347
Tête enseignante GPT0,505
Écart entre enseignants0,158 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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