Loss of genes in chromosome arms 5q and 16q in breast cancer
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Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Losses of genetic material from chromosomes 5q and 16q commonly occur in sub-sets of breast cancer. Their significance from a pathophysiologic point of view is not well-defined. METHODS: This study uses publicly available genomic data from extensive breast cancer datasets to define the landscape of losses in chromosomal arms 5q and 16q in the two sub-types of breast cancer they most commonly occur, basal-like and luminal A cancers, respectively. RESULTS: It is shown that dozens of genes from these chromosomal arms are putatively hemi-deleted in few samples each. No individual gene from either 5q or 16q shows an incidence of deep deletion above 10% in the cohorts with basal-like and luminal A cancers or in the whole cohorts. A few tumor suppressor genes are deleted in a small number of samples, less than 5% in each cohort. Losses of 5q or 16q confer no survival advantage in either the basal-like or the luminal A cohorts from TCGA that harbor them. CONCLUSION: Results suggest that there are no individual genes in chromosomes 5q and 16q whose loss can be implicated in a dominant pathophysiologic sequence of events in breast cancer or its sub-sets.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle