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Enregistrement W4290943230 · doi:10.1136/bmjopen-2021-057852

Diagnostic yield of screening for SARS-CoV-2 among patients admitted to hospital for alternate diagnoses: an observational cohort study

2022· article· en· W4290943230 sur OpenAlexafffundabout
Philip J. Davis, Rhonda J. Rosychuk, Jeffrey P. Hau, Ivy Cheng, Andrew D. McRae, Raoul Daoust, Eddy Lang, Joel Turner, Jaspreet Khangura, Patrick T. Fok, Maja Stachura, Baljeet Brar, Corinne M. Hohl

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensDalhousie UniversityMcGill UniversityUniversity of CalgaryHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreVancouver Coastal HealthVancouver Coastal Health Research InstituteUniversity of British ColumbiaUniversity of SaskatchewanUniversité de MontréalUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesBiotalent CanadaMinistry of Colleges and UniversitiesGenome British ColumbiaCanadian Institutes of Health ResearchSaskatchewan Health Research FoundationPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésMedicineCohortEmergency departmentMedical diagnosisCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Cohort studyPandemicEmergency medicineObservational studySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)PediatricsEpidemiologyRetrospective cohort studyAcute careHealth careInternal medicineDiseasePathologyPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: To determine the diagnostic yield of screening patients for SARS-CoV-2 who were admitted with a diagnosis unrelated to COVID-19 and to identify risk factors for positive tests. DESIGN: Cohort from the Canadian COVID-19 Emergency Department Rapid Response Network registry. SETTING: 30 acute care hospitals across Canada. PARTICIPANTS: Patients hospitalised for non-COVID-19-related diagnoses who were tested for SARS-CoV-2 between 1 March and 29 December 2020. MAIN OUTCOME: Positive nucleic acid amplification test for SARS-CoV-2. OUTCOME MEASURE: Diagnostic yield. RESULTS: We enrolled 15 690 consecutive eligible adults who were admitted to hospital without clinically suspected COVID-19. Among these patients, 122 tested positive for COVID-19, resulting in a diagnostic yield of 0.8% (95% CI 0.64% to 0.92%). Factors associated with a positive test included presence of fever, being a healthcare worker, having a positive household contact or institutional exposure, and living in an area with higher 7-day average incident COVID-19 cases. CONCLUSIONS: Universal screening of hospitalised patients for COVID-19 across two pandemic waves had a low diagnostic yield and should be informed by individual-level risk assessment in addition to regional COVID-19 prevalence. TRIAL REGISTRATION NUMBER: NCT04702945.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,924

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,210
Tête enseignante GPT0,428
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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