MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4290973546 · doi:10.21203/rs.3.rs-1944396/v1

Multi-center Assessment of CNN-Transformer with Belief Matching Loss for Patient-independent Seizure Detection in Scalp and Intracranial EEG

2022· preprint· en· W4290973546 sur OpenAlexaff
Wei Yan Peh, Prasanth Thangavel, Yuanyuan Yao, John Thomas, Yee Leng Tan, Justin Dauwels

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueEEG and Brain-Computer Interfaces
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésElectroencephalographyStereoelectroencephalographyComputer scienceConvolutional neural networkArtificial intelligenceScalpPattern recognition (psychology)PsychologyIctalMedicineNeuroscienceSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Neurologists typically identify epileptic seizures from electroencephalograms (EEGs) by visual inspection. This process is often time-consuming, especially for EEG recordings that last several hours or even days. To expedite the process, a reliable, automated, and patient-independent seizure detector is essential. However, developing a patient-independent seizure detector is challenging as seizures exhibit diverse morphologies and characteristics across different patients and recording devices. In this study, we propose a patient-independent seizure detector to automatically detect seizures in both scalp EEG (sEEG) and intracranial EEG (iEEG). First, we deploy a convolutional neural network (CNN) with transformers (TRF) and belief matching (BM) loss to detect seizures in single-channel EEG segments (channel-level detection). Next, we extract regional features from the channel-level outputs to detect seizures in multi-channel EEG segments (segment-level detection). At last, we apply postprocessing filters to the segment-level outputs to determine the start and end points of seizures in multi-channel EEGs (EEG-level detection). We introduce the minimum overlap evaluation scoring (MOES) as an evaluation metric that accounts for minimum overlap between the detection and seizure, improving upon existing assessment metrics. We trained the seizure detector on the Temple University Hospital Seizure (TUH-SZ) sEEG dataset and evaluated it on five other independent sEEG and iEEG datasets. On the TUH-SZ dataset, the proposed patient-independent seizure detector achieves a sensitivity (SEN), precision (PRE), average and median false positive rate per hour (aFPR/h and mFPR/h), and median offset of 0.772, 0.429, 4.425, 0, and -2.125s, respectively. Across all four adult datasets (excluding neonatal and paediatric datasets), we obtained SEN of 0.617-1.00, PRE of 0.534-1.00, aFPR/h of 0.425-2.002, and mFPR/h of 0-1.003. Meanwhile, on neonatal and paediatric datasets, we obtained SEN of 0.227-0.678, PRE of 0.377-0.818, aFPR/h of 0.253-0.421, and mFPR/h of 0.118-0.223. The proposed seizure detector can reliably detect seizures in adult EEGs (to less extent in neonatal EEGs) and takes less than 15s for a 30 minutes EEG. Hence, this system could potentially aid the clinicians in reliably identifying seizures expeditiously, allocating more time for devising proper treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueResearch SquareMême sujetEEG and Brain-Computer InterfacesTravaux en français237 207