An Overview of Comprehensive Genomic Profiling Technologies to Inform Cancer Care
Notice bibliographique
Résumé
Horizon Scan reports provide brief summaries of information regarding new and emerging health technologies; Heath Technology Update articles typically focus on a single device or intervention. This Horizon Scan summarizes the available information regarding emerging comprehensive genomic profiling (CGP) technologies for informing cancer treatments. These technologies are based on next-generation sequencing platforms, which can characterize up to hundreds of genes and other genomic information with a single sample. Emerging tests are also compatible with minimally invasive liquid biopsies that use fluids such as blood samples to support clinical decision-making. CGP could be an alternative or a complement to conventional testing that uses single-biomarker assays or limited gene panels. Some emerging CGP tests available in Canada, the US, and Europe are being considered to inform the treatment of non–small cell lung cancer (NSCLC) because it has the highest number of identified biomarkers. Most identified studies have examined CGP use with NSCLC. The emerging evidence about the clinical and cost-effectiveness of CGP technologies for either NSCLC or other cancer types remains uncertain. Without randomized trials and robust study designs, it is not yet well-established whether the additional costs and technical requirements of CGP may provide better clinical outcomes compared with conventional molecular testing. This Horizon Scan also provides considerations for health systems about testing infrastructure, training for health care professionals, and understanding different patients’ perspectives should CGP or other next-generation sequencing technologies become more widely used in Canada.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,015 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,009 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,014 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».