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Enregistrement W4291010618 · doi:10.1101/2022.08.09.503341

Assessing the accuracy of paired and random sampling for quantifying plant–plant interactions in natural communities

2022· preprint· en· W4291010618 sur OpenAlexaff
Richard Michalet, Gianalberto Losapio, Zaal Kikvidze, Rob W. Brooker, Bradley J. Butterfield, Ragan M. Callaway, Lohengrin A. Cavieres, Christopher J. Lortie, Francisco I. Pugnaire, Christian Schöb

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEcology and Vegetation Dynamics Studies
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésHabitatSpatial heterogeneityEcologySampling (signal processing)Abiotic componentGeographyAridEnvironmental scienceBiologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Interactions among plant species in extreme ecological systems are often inferred from spatial associations and quantified by means of paired sampling. Yet, this method might be confounded by habitat-sharing effects, in particular when microenvironmental heterogeneity and stress are high. Here, we address whether paired and random sampling methods provide similar results at varying levels of environmental heterogeneity. Furthermore, we investigate how the relationship between species preferences and abiotic severity influences the outcome of these two methods. We quantified spatial associations with the two methods at three sites that encompass different micro-environmental heterogeneity and stress levels: semi-arid environments in Canary Islands, Spain and Sardinia, Italy and a cold alpine environment in Hokkaido (Japan). Then, we simulated plant communities with different levels of species micro-habitat preferences, environmental heterogeneity and stress levels. We found that differences in species associations between paired and random sampling were indistinguishable from zero in our model simulations. At each site, there were strong differences between beneficiary species in their spatial association with benefactor species, and associations became more positive with increasing stress in Spain. Most importantly, there were no differences in the results yielded by the two methods at any of the different stress levels at the Spanish and Japanese sites. At the Italian site, although micro-environmental heterogeneity was low, we found weakly significant differences between methods that were unlikely due to habitat-sharing effects. We conclude that the paired sampling method can provide significant insights into net, long-term effects of plant interactions in spatially conspicuous environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,048
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,092

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,048
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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