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Enregistrement W4291019068 · doi:10.1098/rspb.2022.0635

Big brown bats experience slower epigenetic ageing during hibernation

2022· article· en· W4291019068 sur OpenAlexafffund
Isabel Sullivan, Danielle M. Adams, Lucas J. Greville, Paul A. Faure, Gerald S. Wilkinson

Notice bibliographique

RevueProceedings of the Royal Society B Biological Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBat Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAmerican Society of Mammalogists
Mots-clésdNaMEpigeneticsBiologyHibernation (computing)LongevityDNA methylationAgeingGeneChromatinCognitive declineEvolutionary biologyGenomeGeneticsGene expressionDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Comparative analyses of bats indicate that hibernation is associated with increased longevity among species. However, it is not yet known if hibernation affects biological ageing of individuals. Here, we use DNA methylation (DNAm) as an epigenetic biomarker of ageing to determine the effect of hibernation on the big brown bat, Eptesicus fuscus . First, we compare epigenetic age, as predicted by a multi-species epigenetic clock, between hibernating and non-hibernating animals and find that hibernation is associated with epigenetic age. Second, we identify genomic sites that exhibit hibernation-associated change in DNAm, independent of age, by comparing samples taken from the same individual in hibernating and active seasons. This paired comparison identified over 3000 differentially methylated positions (DMPs) in the genome. Genome-wide association comparisons to tissue-specific functional elements reveals that DMPs with elevated DNAm during winter occur at sites enriched for quiescent chromatin states, whereas DMPs with reduced DNAm during winter occur at sites enriched for transcription enhancers. Furthermore, genes nearest DMPs are involved in regulation of metabolic processes and innate immunity. Finally, significant overlap exists between genes nearest hibernation DMPs and genes nearest previously identified longevity DMPs. Taken together, these results are consistent with hibernation influencing ageing and longevity in bats.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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