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Enregistrement W4291034686 · doi:10.3168/jds.2021-21651

Reproductive tract size and position score: Estimation of genetic parameters for a novel fertility trait in dairy cows

2022· article· en· W4291034686 sur OpenAlexafffund
A.A.A. Martin, Gerson de Oliveira, A.M.L. Madureira, F. Miglior, S.J. LeBlanc, R.L.A. Cerri, Christine F. Baes, Flávio S. Schenkel

Notice bibliographique

RevueJournal of Dairy Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueReproductive Physiology in Livestock
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaGenome AlbertaGenome British ColumbiaGénome QuébecCanadian Dairy CommissionDairy Farmers of CanadaGenome Canada
Mots-clésHeritabilityBiologyFertilityBest linear unbiased predictionStatisticsUnivariateDairy cattleGenetic correlationRepeatabilityTraitAnimal scienceAnimal breedingMultivariate statisticsGenetic variationSelection (genetic algorithm)MathematicsDemographyGeneticsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The dairy industry is moving toward selecting animals with better fertility to decrease the economic losses linked to reproductive issues. The reproductive tract size and position score (SPS) was recently developed in physiological studies as an indicator of pregnancy rate and the number of services to conception. Cows are scored as SPS 1, 2, or 3 based on the size of their reproductive tract and its position in the pelvis, as determined by transrectal palpation. The objective of this study was to estimate genetic parameters for SPS to assess its potential as a novel fertility trait. Phenotypes were collected at the University of British Columbia's research herd from 2017 to 2020, consisting of 3,247 within- and across-lactation SPS records from 490 Holstein cows. A univariate animal model was used to estimate the variance components for SPS. Both threshold and linear models were fit under a Bayesian approach and the results were compared using the Spearman rank correlation (r) between the estimated breeding values. The 2 models ranked the animals very similarly (r = 0.99), and the linear model was selected for further analysis. Genetic correlations with other currently evaluated traits were estimated using a bivariate animal model. The posterior means (± posterior standard deviation) for heritability and repeatability within- and across-lactation were 0.113 (± 0.013), 0.242 (± 0.012), and 0.134 (± 0.014), respectively. The SPS showed null correlations with production traits and favorable correlations with traditional fertility traits, varying from -0.730 (nonreturn rate) to 0.931 (number of services). Although preliminary, these results are encouraging because SPS seems to be more heritable than and strongly genetically correlated with number of services, nonreturn rate, and first service to conception, indicating potential for effective indirect selection response on these traits from SPS genetic selection. Therefore, further studies with larger data sets to validate these findings are warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,048

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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