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Enregistrement W4291115531 · doi:10.1016/j.imu.2022.101046

Novel compounds from endophytic fungi of Ceriops decandra inhibit breast cancer cell growth through estrogen receptor alpha in in-silico study

2022· article· en· W4291115531 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueInformatics in Medicine Unlocked · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiodiversity Institute of OntarioJashore University of Science and TechnologyMinistry of Science and Technology, Government of the People’s Republic of BangladeshUniversity Grants Commission of Bangladesh
Mots-clésPlant use of endophytic fungi in defenseIn silicoFusarium oxysporumEstrogen receptor alphaBiologyEstrogen receptorFusariumFusarium solaniBiochemistryBotanyBreast cancerCancerGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endophytic fungi can thrive without producing illness or injury to the host plant tissues, and they are also one of the major natural sources of bioactive compounds. The objective of the present study was to assess the anticancer potential of fungal extracts obtained from Ceriops decandra and in-silico-based identification of the anticancer constituents from those fungal extracts. Endophytic fungi were isolated and identified by internal transcribed spacer (ITS-rDNA) sequence analysis. The fungal crude extract was subjected to column chromatography and different fractions were screened for bioactive compounds using Gas Chromatography Mass Spectroscopy (GCMS). Fusarium oxysporum, Chlonostachys sp., Fusarium solani were identified from C. decandra. Eighty (80) compounds were identified from these endophytic fungi through GCMS analysis. A molecular docking study of the identified compounds confirmed the anti-cancer potential of breast cancer cells through the estrogen receptor, with good binding affinities (−9.17 to −7.19 kcal/mol) and interaction patterns. Furthermore, in molecular dynamic simulation studies, Isoparvifuran (CID_617473) and 2,4-di-tert-butylphenol (CID_7311) revealed a stable complex with the target protein of estrogen receptor alpha. The result of the study showed that C. decandra harbors diverse group of endophytic fungi that can be a potential source of bioactive (Isoparvifuran and 2,4-di-tert-butylphenol) pharmaceuticals to treat breast cancer through modulation of estrogen receptor alpha.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,270
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle