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Enregistrement W4291149130 · doi:10.3389/fsysb.2022.955611

Metataxonomic insights into the microbial ecology of farm-scale hay, grass or legume, and corn silage produced with and without inoculants

2022· article· en· W4291149130 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Systems Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversité Laval
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNovalait
Mots-clésSilageMicrobial inoculantBiologyForageHayAgronomyPediococcus acidilacticiFood scienceLactobacillus plantarumLactic acidBacteriaHorticultureInoculation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The microbiota of silage is a key determinant of its quality. Although commercial inoculants are often used to improve silage quality, studies to analyze their impact on the microbiota of preserved forage at farm-scale facilities are scarce. We assessed the diversity of viable bacterial communities of hay (unfermented dry forage) and grass or legume (GL) and corn (C) silage to deepen our knowledge of how inoculant addition drives microbial occurrence patterns on dairy farms. Forage samples were collected from 24 dairy farms over two sampling periods. Samples were analyzed by high-throughput sequencing and quantitative PCR after being treated with propidium monoazide to account for viable cells. We found consistent significant differences between hay and silage community structures across sampling periods. Silage was generally dominated by lactic acid bacteria (LAB), while Pantoea and Sphingomonas were the main co-dominant genera in hay. The GL silage dominated by Pediococcus , Weissella , and Bacillus was phylogenetically different from C silage enriched in Acetobacter . The use of inoculants including Lentilactobacillus buchneri either alone or in combination with Lactiplantibacillus plantarum , Lacticaseibacillus casei , Pediococcus pentosaceus , or Enterococcus faecium did not systematically prevent the occurrence of undesirable bacteria, especially when corn-based, probably because of factors that can mitigate the effect of inoculation on the microbiota. The core Lactobacillales constituted the dominant LAB in silage with up to 96% relative abundance, indicating either the ubiquity of inoculants or the high competitiveness of epiphytes. Silage chemical profiles varied inconsistently with sampling periods and the use of inoculants. Multivariate multi-table analyses allowed the identification of bacterial clusters mainly driven by moisture and magnesium content in hay, while pH, lactic, and fatty acids were the main drivers for silage. Bacterial network analyses showed considerable variations in the topological roles with the use of inoculants. These results may help evaluate the effectiveness of forage management practices implemented on dairy farms and, therefore, are useful for fine-tuning the search for new additives. Such knowledge can be used by forage makers to adjust processing routines to improve the hygienic quality, nutritional potential, and aerobic stability of preserved forage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,314
Score d'incertitude au seuil0,213

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle