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Enregistrement W4291826702 · doi:10.3354/meps14155

Experimental validation confirms a carbon stable isotope lipid normalization procedure for Pacific salmon

2022· article· en· W4291826702 sur OpenAlexafffund
JE Lerner, BPV Hunt

Notice bibliographique

RevueMarine Ecology Progress Series · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueIsotope Analysis in Ecology
Établissements canadiensTula FoundationUniversity of British ColumbiaFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesHakai Institute
Mots-clésChinook windNormalization (sociology)OncorhynchusStable isotope ratioIsotopeIsotopes of carbonIsotope analysisChemistryFish <Actinopterygii>BiologyEcologyFisheryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Carbon stable isotope analysis is an important tool in studies of fish ecology. Studies using this tool must account for the effect of lipids present in fish tissue on carbon stable isotope (δ13C) values. Simple correction equations have been developed to correct for this effect. For taxa with high fat content, choosing an accurate correction equation can have a significant impact on results. Pacific salmon (Oncorhynchus spp.) are a lipid-rich genus. Their broad marine distribution and ecological, cultural, and commercial importance make them prime candidates for stable isotope analysis. To determine both an accurate lipid correction equation for Pacific salmon δ13C values, and the effect of lipid extraction on bulk nitrogen isotope (δ15N) values, we performed pairwise isotope analysis on lipid-extracted and untreated muscle samples from 68 Chinook salmon O. tshawytscha spanning a size range of 165-750 mm and C:N values of 2.96-14.25. We compared the fit of existing δ13C lipid correction equations from 3 previously published models to our data, and optimized the top performing model using a leave-one-out cross validation. The model of Kiljunen et al. (2006; https://doi.org/10.1111/j.1365-2664.2006.01224.x) performed the best (mean squared error: 0.22, r2: 0.91), while the optimized model only slightly improved on it (MSE: 0.20, r2: 0.93). For δ15N, we determined that Chinook δ15N values significantly increased by 0.6‰ following lipid extraction. Our results confirm a lipid normalization procedure that is broadly applicable to Pacific salmon, and supports streamlined analysis of δ13C and δ15N from a single untreated muscle tissue sample.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,073

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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