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Enregistrement W4291997272 · doi:10.1101/2022.08.12.22278567

Performance of the Cue COVID-19 Molecular Test for Point of Care: Insights from a multi-site clinic service model

2022· preprint· en· W4291997272 sur OpenAlexaboutno aff
Anu Rebbapragada, Lane Cariazo, David Elchuk, Hossam M. Abdel-Rahman, Dang Duy Quang Pham, Nirochile Joseph, Elena Gouzenkova, Harpreet Gill, Peter Blecher

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPoint-of-care testingMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Nucleic Acid Amplification TestsPopulationPoint of careMedical emergencyTest (biology)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Medical physicsEmergency medicinePathologyVirologyDiseaseBiologyInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The COVID-19 pandemic highlighted the critical need for rapid and accurate molecular diagnostic testing. The Cue COVID-19 Point of Care Test (Cue POCT) is a nucleic acid amplification test (NAAT), authorized by Health Canada and FDA as a POCT for SARS-CoV-2 detection. Cue POCT was deployed at a network of clinics in Ontario, Canada with n=13,848 patrons tested between July 17, 2021 to January 31, 2022. The clinical performance and operational experience with Cue POCT was examined for this testing population composed mostly of asymptomatic individuals (93.7%). A head-to-head prospective clinical verification was performed between July 17 to October 4 for all POCT service clients (n= 3037) with paired COVID-19 testing by Cue and RT-PCR. Prospective verification demonstrated a clinical sensitivity of 100% and clinical specificity of 99.4% for Cue COVID-19 POCT. The lack of false negatives and low false positive rate (0.64%), underscores the high accuracy (99.4%) of Cue POCT to provide rapid PCR quality results. Low error rates (cancellation rate of 0% and invalid rate of 0.63%) with the current software version were additionally noted. Together these findings highlight the value of accurate molecular COVID-19 POCT in a distributed service delivery model to rapidly detect cases in the community with the potential to curb transmission in high exposure settings (i.e. in-flight, congregate workplace and social events). The insights gleaned from this operational implementation are readily transferable to future POCT diagnostic services.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,570
Score d'incertitude au seuil0,867

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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