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Enregistrement W4292176380 · doi:10.1101/2022.08.13.22278732

Development and validation of an end-to-end deep learning pipeline to measure pericardial effusion in echocardiography

2022· preprint· en· W4292176380 sur OpenAlexaff
Cheng‐Ching Wu, Chi-Yung Cheng, Huang‐Chung Chen, Chun-Huei Hung, Tien‐Yu Chen, Chun‐Hung Richard Lin, I-Min Chiu

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePericarditis and Cardiac Tamponade
Établissements canadiensNutrasource
Organismes subventionnairesKaohsiung Chang Gung Memorial HospitalChang Gung Medical Foundation
Mots-clésIntraclass correlationPericardial effusionParasternal lineMedicinePipeline (software)Receiver operating characteristicArtificial intelligenceRadiologyComputer scienceSurgeryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction Cardiac tamponade, caused by pericardial effusion (PE), is a life-threatening condition that can be resolved by timely pericardiocentesis. Nevertheless, PE measurement remains operator-dependent and may be difficult in some circumstances. Our study aimed to develop a deep-learning pipeline that measures the amount of PE based on raw echocardiography clips. Methods Echocardiographic examination data were collected from one medical center in southern Taiwan from 2010–2018. Four commonly used cardiac windows, including the parasternal long-axis, parasternal short-axis, apical four-chamber, and subcostal views from included ultrasound examinations, were used for analysis. We proposed a deep learning pipeline consisting of three steps: moving window view selection, automated segmentation, and width calculation from a segmented mask. The pipeline was then prospectively validated from 2019–2020 using a dataset from the same hospital, and externally validated using data from another medical center in Taiwan. Model performance was evaluated using mean absolute error, intraclass correlation coefficient (ICC), and R-squared value between the ground truth and predictions. Results In this study, 995 echocardiographic examinations were included. Among these, 155 were used for internal validation and 258 were used for external validation. The proposed pipeline had a predictive performance of ICC=0.867 for internal validation and ICC=0.801 for external validation. It accurately detected PE with an area under the receiving operating characteristic curve (AUC) of 0.926 (0.902–0.951) for internal validation and 0.842 (0.794–0.889) for external validation. Regarding the recognition of moderate PE or worse, the AUC values improved to 0.941 (0.923–-0.960) and 0.907 (0.876–0.943) for internal and external validation, respectively. Of all the selected cardiac windows, our model had the best prediction in the parasternal long-axis and apical four-chamber views. Conclusions The machine-learning pipeline could automatically calculate the width of the PE from raw ultrasound clips. The novel concepts of moving window view selection for image quality control and computer vision techniques for maximal PE width calculation seem useful in the field of ultrasound.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,312
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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