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Enregistrement W4292295879 · doi:10.1039/d2cs00387b

Discovery of small molecule ligands for the von Hippel-Lindau (VHL) E3 ligase and their use as inhibitors and PROTAC degraders

2022· review· en· W4292295879 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueChemical Society Reviews · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFP7 People: Marie-Curie ActionsFP7 Ideas: European Research CouncilBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilEuropean CommissionDirectorate for Biological SciencesEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsHorizon 2020 Framework ProgrammeUniversity of DundeeH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsInnovative Medicines InitiativeMcGill University
Mots-clésDNA ligaseUbiquitin ligaseSmall moleculeChemistryComputational biologyCombinatorial chemistryBiochemistryStereochemistryUbiquitinDNABiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The von Hippel-Lindau (VHL) Cullin RING E3 ligase is an essential enzyme in the ubiquitin-proteasome system that recruits substrates such as the hypoxia inducible factor for ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. The ubiquitin-proteasome pathway can be hijacked toward non-native neo-substrate proteins using proteolysis targeting chimeras (PROTACs), bifunctional molecules designed to simultaneously bind to an E3 ligase and a target protein to induce target ubiquitination and degradation. The availability of high-quality small-molecule ligands with good binding affinity for E3 ligases is fundamental for PROTAC development. Lack of good E3 ligase ligands as starting points to develop PROTAC degraders was initially a stumbling block to the development of the field. Herein, the journey towards the design of small-molecule ligands binding to VHL is presented. We cover the structure-based design of VHL ligands, their application as inhibitors in their own right, and their implementation into rationally designed, potent PROTAC degraders of various target proteins. We highlight the key findings and learnings that have provided strong foundations for the remarkable development of targeted protein degradation, and that offer a blueprint for designing new ligands for E3 ligases beyond VHL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,887
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle