Haemosporidian parasite diversity and prevalence in the songbird genus<i>Junco</i>across Central and North America
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The evolution of host–parasite interactions as host lineages colonize new geographic regions and diversify over evolutionary time is poorly understood. To assess whether haemosporidian parasite diversity has changed during the diversification of an avian host, we surveyed the diversity and prevalence of blood parasite lineages (genera Plasmodium, Haemoproteus, and Leucocytozoon) across the range of the songbird genus Junco, which has diversified recently as it recolonized North America following the last glacial maximum ~18,000 years ago. We report the diversity and prevalence of parasites in junco taxa sampled from Costa Rica to Canada, and examine the influence of local avian species richness in the prevalence and diversity of parasites in junco samples. We screened for parasites in each individual by sequencing a fragment of their cytochrome b gene, identifying the different lineages, and quantifying the prevalence per junco taxon and locality. Of 304 juncos sampled, 178 tested positive for 1 or more parasite genera (58.5% overall prevalence). We found high parasite diversity in genera Haemoproteus and Leucocytozoon and much lower diversity in Plasmodium. Among the 63 parasite lineages detected, 32 of which have not been previously described, we found generalist lineages with widespread but low prevalence in Junco, but also some that appear to have remained specialized on this genus as it diversified across North America over thousands of years. Our results suggest a range of parasitic strategies, ranging from specialized to generalist lineages within single parasite genera.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».