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Enregistrement W4292356922 · doi:10.1111/zsc.12559

The (non) accuracy of mitochondrial genomes for family‐level phylogenetics in Erebidae (Lepidoptera)

2022· article· en· W4292356922 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueZoologica Scripta · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLepidoptera: Biology and Taxonomy
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesVetenskapsrådet
Mots-clésErebidaeBiologyPhylogenetic treeMitochondrial DNAEvolutionary biologySubfamilyPhylogeneticsGenomeDNA sequencingSystematicsGeneticsLepidoptera genitaliaZoologyTaxonomy (biology)GeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The use of molecular data to study the evolutionary history of organisms has revolutionized the field of systematics. Now with the appearance of high throughput sequencing (HTS) technologies, more and more genetic sequence data are available. One of the important sources of genetic data for phylogenetic analyses has been mitochondrial DNA. The limitations of mitochondrial DNA for the study of phylogenetic relationships have been thoroughly explored in the age of single locus phylogenetic studies. Now with the appearance of genomic scale data, increasing number of mitochondrial genomes are available, leading to an increasing number of mitophylogenomic studies. Here, we assemble 47 mitochondrial genomes using whole genome Illumina short reads from representatives of the family Erebidae (Lepidoptera), in order to evaluate the accuracy of mitochondrial genome application in resolving deep phylogenetic relationships. We find that mitogenomes are inadequate for resolving subfamily‐level relationships in Erebidae, but given good taxon sampling, we see its potential in resolving lower level phylogenetic relationships.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,947
Score d'incertitude au seuil0,572

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle