Surveillance of Viruses in <i>Varroa destructor</i> Samples Collected from Honey Bee Colonies in Ontario, Canada, between 2015 and 2019
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Varroa destructor parasitism is associated with extreme honey bee ( Apis mellifera ) colony losses in the northern hemisphere. Varroa destructor causes severe damage, including a decrease in bee longevity and immunosuppression, and acts as a vector for viruses, such as Deformed wing virus (DWV-A). The surveillance of viral pathogens in V. destructor samples is essential to assess risks of emerging virulent viral variants (such as VDV-1) and evaluate their impact on honey bee health. Thus, the objective of this study was to identify viral pathogens in V. destructor and honey bee samples collected in Ontario, Canada, from 2015 to 2019 with the use of metagenomics and real time PCR (qPCR). DWV-A and VDV-1 had the highest abundance of viral transcripts (7.5 log2 and 5.72 log2, respectively). Acute bee paralysis virus (ABPV) and Bee macula virus were also identified. Viral identification and quantification in V. destructor samples using metagenomics will facilitate the surveillance of viral pathogens. This surveillance technique will assist diagnostic laboratories in delivering timely and accurate diagnoses and risk assessments, which in turn will help honey bee producers to take adequate measures to mitigate the damage caused by V. destructor and associated viruses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».