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Enregistrement W4292550264 · doi:10.1016/j.crphys.2022.07.005

Proteomic analysis of temperature-dependent developmental plasticity within the ventricle of juvenile Atlantic salmon (Salmo salar)

2022· article· en· W4292550264 sur OpenAlexafffund
Carlie A. Muir, Bradley S. Bork, Bryan D. Neff, Sashko Damjanovski

Notice bibliographique

RevueCurrent Research in Physiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologySalmoJuvenileVentriclePhenotypic plasticityHeart developmentZebrafishInternal medicineDevelopmental plasticityHomeostasisAcclimatizationZoologyCell biologyPlasticityEcologyFish <Actinopterygii>GeneGeneticsFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In teleosts, cardiac plasticity plays a central role in mediating thermal acclimation. Previously, we demonstrated that exposure to elevated temperatures throughout development (+4°C) improved acute thermal tolerance of the heart in juvenile Atlantic salmon. Fish raised in a warmer thermal regime also displayed higher proportions of compact myocardium within their ventricles. In the present study, we investigated the molecular mechanisms supporting this temperature-specific phenotype by comparing relative protein abundance in ventricular tissue from the same experimental fish using mass spectrometry. We provide the first description of the ventricular proteome in juvenile Atlantic salmon and identify 79 proteins displaying differential abundance between developmental treatments. The subset of proteins showing higher abundance in fish raised under elevated temperatures was significantly enriched for processes related to ventricular tissue morphogenesis, and changes in protein abundance support a hypertrophic model of compact myocardium growth. Proteins associated with the vasculature and angiogenesis also showed higher abundance in the warm-developmental group, suggesting capillarization of the compact myocardium in the hearts of these fish. Proteins related to oxidative metabolism and protein homeostasis also displayed substantive shifts in abundance between developmental treatments, underscoring the importance of these processes in mediating thermal plasticity of cardiac function. While rapid growth under warm developmental temperatures has been linked to cardiomyopathies in farmed salmon, markers of cardiac pathology were not implicated in the present study. Thus, our findings offer a molecular footprint for adaptive temperature-dependent plasticity within the ventricle of a juvenile salmonid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,856
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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