Synthesis of <i>Ortho</i>‐Functionalized Tetrachlorinated Azobenzene Phosphoramidites for Incorporation Into siRNAzos for Photocontrolled Gene Silencing
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract This paper contains the detailed synthesis and characterization protocols of ortho‐ functionalized tetrachlorinated azobenzene‐containing small interfering RNAs (siRNAs), which have photoswitchable properties effectively controlled with visible light. To design this tetrachlorinated azobenzene scaffold, a late‐stage chlorination with N ‐chlorosuccinimide and palladium is used. Next, a single hydroxyl group from the tetrachlorinated azobenzene is protected with a 4,4′‐dimethoxytrityl (DMT) group, followed by phosphitylation with 2‐cyanoethyl‐ N,N ‐diisopropylchlorophosphoramidite. These phosphoramidite monomers are compatible with automated solid‐phase oligonucleotide synthesis to generate tetrachlorinated azobenzene‐containing oligonucleotides. This paper also contains the detailed biophysical characterization, biological testing, and photo‐switching protocols of ortho ‐functionalized chlorinated azobenzene‐containing siRNAs (Cl‐siRNAzos), which have photoswitchable properties that can be controlled with visible light. First, the Cl‐siRNAzos are characterized by annealing the sense and antisense strands together and then measuring the circular dichroism (CD) profile, and the melting temperatures ( T m ) of the duplexes. Secondly, the biological testing of the Cl‐siRNAzos in cell culture is done to determine their gene silencing efficacy. Finally, their gene‐silencing activities are measured after exposure to red light in order to inactivate the Cl‐siRNAzo, and then either violet light or infrared thermal relaxation is deployed, which re‐activates the Cl‐siRNAzo. © 2022 Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol 1 : Synthesis of 4,4′‐bis(hydroxyethyl) ortho‐ functionalized tetrachlorinated azobenzene phosphoramidite ( 5 ) Basic Protocol 2 : Synthesis, purification, and characterization of siRNAs containing ortho‐ functionalized tetrachlorinated azobenzene Basic Protocol 3 : Gene‐silencing evaluation of ortho‐ functionalized tetrachlorinated azobenzene using firefly luciferase
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle