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Enregistrement W4292857500 · doi:10.1016/j.gim.2022.07.013

A homozygous MED11 C-terminal variant causes a lethal neurodegenerative disease

2022· article· en· W4292857500 sur OpenAlexaff
Elisa Calì, Sheng‐Jia Lin, Clarissa Rocca, Yavuz Şahin, Aisha Al Shamsi, Salima El Chehadeh, Myriam Châabouni, Kshitij Mankad, Evangelia Galanaki, Stéphanie Efthymiou, Sniya Sudhakar, Alkyoni Athanasiou‐Fragkouli, Tamer Çelik, Nejat Narlı, Sebastiano Bianca, David Murphy, Francisco Martins De Carvalho Moreira, Michael G. Hannah, Enrico Bugiardini, Yamna Kriouile, M. El Khorassani, M. Aguennouz, Stanislav Groppa, Blagovesta Marinova Karashova, Gabriella Di Rosa, Jatinder S. Goraya, Tipu Sultan, Daniela Avdjieva, Hadil Kathom, Radka Tincheva, Selina Banu, Pierangelo Veggiotti, Alberto Verrotti, Salvatore Savasta, Alfons Macaya Ruiz, Barbara Garavaglia, Eugenia Borgione, Savvas Papacostas, Chiara Compagnoni, Alessandra Piccirilli, Michail Vikelis, Viorica Chelban, Rauan Kaiyrzhanov, Andrea Cortese, Roisin Sullivan, Eleni Zamba Papanicolaou, Shazia Maqbool, Shahnaz Ibrahim, Salman Kirmani, Nuzhat Rana, Osama Atawneh, Shen‐Yang Lim, Mohd. Farooq Shaikh, Annarita Scardamaglia, Salvatore Mangano, Carmela Scuderi, Giovanna Morello, Massimo Zollo, Gali Heimer, Pasquale Striano, Issam Al-Khawaja, Fuad Al-Mutairi, Fowzan S. Alkuraya, Mie Rizig, Chingiz Shashkin, Nazira Zharkynbekova, Kairgali Koneyev, Ganieva Manizha, Maksud Isrofilov, Ulviyya Guliyeva, Kamran Salayev, Samson Khachatryan, Georgia Xiromerisiou, Cleanthe Spanaki, Arianna Tucci, Chiara Fiorillo, Federico Rissotto, Francina Munell, Antonella Gagliano, Farida Jan, Roberto Chimenz, Eloisa Gitto, Caterina Cuppari, Carmelo Romeo, Francesca Magrinelli, Neerja Gupta, Madhulika Kabra, Hanène Benrhouma, Mériem Tazir, Luca Zagaroli, Claudia Caloisi, Cecilia Fabiano, Gabriella Bottone, Giovanni Farello, Sandra Di Fabio, Makram Obeid, Sophia Bakhtadze, Nebal Waill Saadi, Maha S. Zaki, Chahnez Triki, Majdi Kara, Vincenzo Belcastro, Nicola Specchio, Ehsan Ghayoor Karimiani, Ahmed Salih, Luca A. Ramenghi, Emanuele David, Riccardo Curró, Maria Laura Iezzi, Giulia Iapadre, Giuliana Nanni, Giovanna Scorrano, Maria Francesca Fiorile, Francesco Brancati, Giovanna Di Falco, Luana Mandarà, Giuseppe Barrano, Maurizio Elia, Gaetano Terrone, Francesca Felicia Operto, Mariella Valenzise, Ylenia Della Rocca, Francesca Zazzeroni, Edoardo Alesse, Filippo Manti, Serena Galosi, Francesca Nardecchia, Vincenzo Leuzzi, Erica Pironti, Greta Amore, G Ceravolo, Faisal Zafar, Ehsan Ullah, Erum Afzal, Iram Javed, Fatima Rahman, Muhammad Mehboob Ahmed, Pasquale Parisi, Paola Borgia, Giuseppe Donato Mangano, Francesco Chiarelli, Queen Square Genomics, Andrea Accogli, Cassidy Petree, Kevin Huang, Kamel Monastiri, Masoud Edizadeh, Rosaria Nardello, Marzia Ognibene, Patrizia De Marco, Martino Ruggieri, Federico Zara, Lihadh Al‐Gazali, Marie Thérèse Abi Warde, Bénédicte Gérard, Giovanni Zifarelli, Christian Beetz, Sara Fortuna, Miguel A. Soler, Enza Maria Valente, Gaurav K. Varshney, Reza Maroofian, Vincenzo Salpietro, Henry Houlden

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilRosetrees TrustNational Institute for Health and Care ResearchBrain Research UKUniversity College LondonWellcome Trust
Mots-clésNeurodegenerationExome sequencingBiologyZebrafishPhenotypeMicrocephalyLoss functionGeneticsProtein subunitDiseaseCRISPRMedicineNeuroscienceGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The mediator (MED) multisubunit-complex modulates the activity of the transcriptional machinery, and genetic defects in different MED subunits (17, 20, 27) have been implicated in neurologic diseases. In this study, we identified a recurrent homozygous variant in MED11 (c.325C>T; p.Arg109Ter) in 7 affected individuals from 5 unrelated families. METHODS: To investigate the genetic cause of the disease, exome or genome sequencing were performed in 5 unrelated families identified via different research networks and Matchmaker Exchange. Deep clinical and brain imaging evaluations were performed by clinical pediatric neurologists and neuroradiologists. The functional effect of the candidate variant on both MED11 RNA and protein was assessed using reverse transcriptase polymerase chain reaction and western blotting using fibroblast cell lines derived from 1 affected individual and controls and through computational approaches. Knockouts in zebrafish were generated using clustered regularly interspaced short palindromic repeats/Cas9. RESULTS: The disease was characterized by microcephaly, profound neurodevelopmental impairment, exaggerated startle response, myoclonic seizures, progressive widespread neurodegeneration, and premature death. Functional studies on patient-derived fibroblasts did not show a loss of protein function but rather disruption of the C-terminal of MED11, likely impairing binding to other MED subunits. A zebrafish knockout model recapitulates key clinical phenotypes. CONCLUSION: Loss of the C-terminal of MED subunit 11 may affect its binding efficiency to other MED subunits, thus implicating the MED-complex stability in brain development and neurodegeneration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,623
Score d'incertitude au seuil0,737

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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