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Enregistrement W4293055509 · doi:10.1101/2022.06.23.22276824

Protection against Omicron BA.2 reinfection conferred by primary Omicron or pre-Omicron infection with and without mRNA vaccination

2022· preprint· en· W4293055509 sur OpenAlexafffundabout
Sara Carazo, Danuta M. Skowronski, Marc Brisson, Sapha Barkati, Chantal Sauvageau, Nicholas Brousseau, Rodica Gilca, Judith Fafard, Denis Talbot, Moussa Ouakki, Vladimir Gîlca, Alex Carignan, Geneviève Deceuninck, Philippe De Wals, Gaston De Serres

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeMcGill UniversityCentre hospitalier de l'Université LavalBC Centre for Disease ControlUniversité LavalInstitut National de Santé Publique du Québec
Organismes subventionnairesMinistère de la SantéMinistère de la Santé et des Services sociaux
Mots-clésVaccinationMedicineVirologyGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background We estimated the protection against the Omicron BA.2 variant associated with prior primary infection (PI) due to pre-Omicron or Omicron BA.1 virus, with and without mRNA vaccination. Methods A test-negative case-control study was conducted among healthcare workers (HCWs) tested for SARS-CoV-2 in Quebec, Canada, between March 27 and June 4, 2022, when BA.2 predominated and was presumptively diagnosed. Logistic regression models compared the likelihood of BA.2 reinfection (second positive test ≥30 days after PI) among HCWs with history of PI and none to three doses of mRNA vaccine versus infection-naïve, unvaccinated HCWs. Findings Among 37,732 presumed BA.2 cases, 2,521 (6.7%) and 659 (1.7%) were reinfections following pre-Omicron or BA.1 PI, respectively. Among 73,507 controls, 7,360 (10.0%) and 12,315 (16.8%) had a pre-Omicron or BA.1 PI, respectively. Pre-Omicron PI was associated with 38% (95%CI:19-53) reduction in BA.2 infection risk, with higher BA.2 protection among those also vaccinated with one (56%), two (69%) or three (70%) vaccine doses. Omicron BA.1 PI was associated with greater protection against BA.2 (72%; 95%CI:65-78), higher among two-dose vaccinated at 96% (95%CI:95-96) but not improved with a third dose (96%; 95%CI:95-97). Hybrid Omicron BA.1 PI plus two or three dose vaccine-induced protection persisted for five months post-infection. Interpretation Twice-vaccinated individuals who experienced BA.1 infection were subsequently well-protected for a prolonged period against BA.2 reinfection and derived no meaningful added benefit against BA.2 from a third dose of mRNA vaccine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,202
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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