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Enregistrement W4293068820 · doi:10.1038/s41588-022-01104-0

Rare coding variation provides insight into the genetic architecture and phenotypic context of autism

2022· review· en· W4293068820 sur OpenAlexaff
Jack Fu, F. Kyle Satterstrom, Minshi Peng, Harrison Brand, Ryan L. Collins, Shan Dong, Brie Wamsley, Lambertus Klei, Lily Wang, Stephanie P. Hao, Christine Stevens, Caroline Cusick, Mehrtash Babadi, Eric Banks, Brett Collins, Sheila Dodge, Stacey B. Gabriel, Laura D. Gauthier, Samuel K. Lee, Lindsay Liang, Alicia Ljungdahl, Behrang Mahjani, Laura Sloofman, Andrey N. Smirnov, Mafalda Barbosa, Catalina Betancur, Alfredo Brusco, Brian Hon‐Yin Chung, Edwin H. Cook, Michael L. Cuccaro, Enrico Domenici, Giovanni Battista Ferrero, J. Jay Gargus, Gail E. Herman, Irva Hertz‐Picciotto, Patrı́cia Maciel, Dara S. Manoach, Maria Rita Passos‐Bueno, Antonio M. Persico, Alessandra Renieri, James S. Sutcliffe, Flora Tassone, Elisabetta Trabetti, Gabriele da Silva Campos, Simona Cardaropoli, Diana Carli, Marcus C.Y. Chan, Chiara Fallerini, Elisa Giorgio, Ana Cristina De Sanctis Girardi, Emily Hansen‐Kiss, So Lun Lee, Carla Lintas, Yunin Ludeña, Rachel Nguyen, Lisa Pavinato, Margaret A. Pericak‐Vance, Isaac N. Pessah, Rebecca J. Schmidt, Moyra Smith, Claudia Ismania Samogy Costa, Slavica Trajkova, Jaqueline Y. T. Wang, Mullin H.C. Yu, Branko Aleksić, Mykyta Artomov, Elisa Benetti, Monica Biscaldi-Schafer, Anders D. Børglum, Ángel Carracedo, Andreas G. Chiocchetti, Hilary Coon, Ryan N. Doan, Montse Fernández‐Prieto, Christine M. Freitag, Sherif Gerges, Stephen J. Guter, David M. Hougaard, Christina M. Hultman, Suma Jacob, Miia Kaartinen, Alexander Kolevzon, Itaru Kushima, Terho Lehtimäki, Caterina Lo Rizzo, Nell Maltman, Marianna Manara, Gal Meiri, Idan Menashe, Judith Miller, Nancy J. Minshew, Matthew W. Mosconi, Norio Ozaki, Aarno Palotie, Mara Parellada, Kaija Puura, Abraham Reichenberg, Sven Sandin, Stephen W. Scherer, Sabine Schlitt, Lauren Schmitt, Katja Schneider-Momm, Paige M. Siper, Pål Surén, John A. Sweeney, Karoline Teufel, Maria del Pilar Trelles, Lauren A. Weiss, Ryan K. C. Yuen, David J. Cutler, Silvia De Rubeis, Joseph D. Buxbaum, Mark J. Daly, Bernie Devlin, Kathryn Roeder, Stephan Sanders, Michael E. Talkowski

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2022
Typereview
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Human Genome Research InstituteSimons FoundationEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentAutism SpeaksNational Institute of Mental HealthU.S. Department of Health and Human ServicesNational Science Foundation
Mots-clésBiologyGenetic architecturePhenotypeVariation (astronomy)AutismGeneticsCoding (social sciences)Context (archaeology)Genetic variationComputational biologyEvolutionary biologyGeneDevelopmental psychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations617
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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