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Enregistrement W4293109403 · doi:10.1002/pro.4383

High‐efficiency recombinant protein purification using <scp>mCherry</scp> and <scp>YFP</scp> nanobody affinity matrices

2022· article· en· W4293109403 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueProtein Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMcMaster UniversityMayo Clinic
Mots-clésmCherryFusion proteinFLAG-tagRecombinant DNATandem affinity purificationGreen fluorescent proteinYellow fluorescent proteinAffinity chromatographyMyc-tagProtein purificationProtein tagExpression vectorBiologyTarget proteinProtein engineeringHEK 293 cellsMolecular biologyChemistryBiochemistryEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mammalian cell lines are important expression systems for large proteins and protein complexes, particularly when the acquisition of post-translational modifications in the protein's native environment is desired. However, low or variable transfection efficiencies are challenges that must be overcome to use such an expression system. Expression of recombinant proteins as a fluorescent protein fusion enables real-time monitoring of protein expression, and also provides an affinity handle for one-step protein purification using a suitable affinity reagent. Here, we describe a panel of anti-GFP and anti-mCherry nanobody affinity matrices and their efficacy for purification of GFP/YFP or mCherry fusion proteins. We define the molecular basis by which they bind their target proteins using X-ray crystallography. From these analyses, we define an optimal pair of nanobodies for purification of recombinant protein tagged with GFP/YFP or mCherry, and demonstrate these nanobody-sepharose supports are stable to many rounds of cleaning and extended incubation in denaturing conditions. Finally, we demonstrate the utility of the mCherry-tag system by using it to purify recombinant human topoisomerase 2α expressed in HEK293F cells. The mCherry-tag and GFP/YFP-tag expression systems can be utilized for recombinant protein expression individually or in tandem for mammalian protein expression systems where real-time monitoring of protein expression levels and a high-efficiency purification step is needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,116
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle