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Enregistrement W4293150221 · doi:10.1101/2022.08.23.22278845

Loss of symmetric cell division of apical neural progenitors drives <i>DENND5A</i> -related developmental and epileptic encephalopathy

2022· preprint· en· W4293150221 sur OpenAlexafffund
Emily Banks, Vincent Francis, Sheng‐Jia Lin, Fares Kharfallah, Vladimir Fonov, Maxime Levesque, Chanshuai Han, Gopinath Kulasekaran, Marius Tuznik, Armin Bayati, Reem A. Alkhater, Fowzan S. Alkuraya, Loukas Argyriou, Meisam Babaei, Melanie Bahlo, Behnoosh Bakhshoodeh, Eileen Barr, Lauren Bartik, Mahmoud Bassiony, Miriam Bertrand, Dominique Braun, Rebecca Buchert, M Budetta, Maxime Cadieux‐Dion, Daniel G. Calame, Heidi Cope, Donna Cushing, Stéphanie Efthymiou, Marwa Abd Elmaksoud, Huda G. El Said, Tawfiq Froukh, Harinder Gill, Joseph G. Gleeson, Laura Gogoll, Elaine Goh, Vykuntaraju K. Gowda, Tobias B. Haack, Stefan Hauser, Trevor L. Hoffman, Jacob S. Hogue, A Hosokawa, Henry Houlden, Kevin Huang, Stephanie Huynh, Ehsan Ghayoor Karimiani, Silke Kaulfuß, G. Christoph Korenke, Amy Kritzer, Hane Lee, James R. Lupski, Elysa J. Marco, Kirsty McWalter, Arakel Minassian, Berge A. Minassian, David Murphy, Juanita Neira‐Fresneda, Hope Northrup, Denis M. Nyaga, Barbara Oehl‐Jaschkowitz, Matthew Osmond, Richard Person, Davut Pehli̇van, Cassidy Petree, Lynette G. Sadleir, Carol Saunders, Ludger Schoels, Vandana Shashi, R. Spillman, Varunvenkat M. Srinivasan, Paria Najarzadeh Torbati, Tülay Tos, Maha S. Zaki, Dihong Zhou, Christiane Zweier, Jean‐François Trempe, Thomas M. Durcan, Ziv Gan‐Or, Massimo Avoli, Cesar Alves, Guarav K. Varshney, Reza Maroofian, David A. Rudko, Peter S. McPherson

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensUniversity of OttawaHospital for Sick ChildrenBritish Columbia Centre of Excellence for Women's HealthB.C. Women's Hospital & Health CentreTrillium Health CentreChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCommon FundOffice of Strategic CoordinationOntario GenomicsNational Institutes of HealthKing Salman Center for Disability ResearchGenome AlbertaOntario Genomics InstituteGenome British ColumbiaCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaDeutscher Akademischer AustauschdienstNIH Office of the DirectorU.S. Department of Defense
Mots-clésNeurogenesisBiologyProgenitor cellMitosisNeural stem cellNeuroscienceSubventricular zoneCell divisionCentrosomeAsymmetric cell divisionCell biologyStem cellCellCell cycleGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Developmental and epileptic encephalopathies (DEEs) are a heterogenous group of epilepsies in which altered brain development leads to developmental delay and seizures, with the epileptic activity further negatively impacting neurodevelopment. Identifying the underlying cause of DEEs is essential for progress toward precision therapies. Here we describe a group of individuals with biallelic variants in DENND5A and determine that variant type is correlated with disease severity. We demonstrate that DENND5A interacts with MUPP1 and PALS1, components of the Crumbs apical polarity complex, which is required for both neural progenitor cell identity and the ability of these stem cells to divide symmetrically. Induced pluripotent stem cells lacking DENND5A fail to undergo symmetric cell division during neural induction and have an inherent propensity to differentiate into neurons, and transgenic DENND5A mice, with phenotypes like the human syndrome, have an increased number of neurons in the adult subventricular zone. Disruption of symmetric cell division following loss of DENND5A results from misalignment of the mitotic spindle in apical neural progenitors. A subset of DENND5A is localized to centrosomes, which define the spindle poles during mitosis. Cells lacking DENND5A orient away from the proliferative apical domain surrounding the ventricles, biasing daughter cells towards a more fate-committed state and ultimately shortening the period of neurogenesis. This study provides a mechanism behind DENND5A -related DEE that may be generalizable to other developmental conditions and provides variant-specific clinical information for physicians and families.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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