Integrated Immunopeptidomics and Proteomics Study Reveals Imbalanced Innate and Adaptive Immune Responses to SARS-Cov-2 Infection
Notice bibliographique
Résumé
Abstract We present an integrated immunopeptidomics and proteomics study of SARS-Cov-2 infection to comprehensively decipher the changes in host cells in response to viral infection. Our results indicated that innate immune response in Calu-3 cells was initiated by TLR3, followed by activation of interferon signaling pathway. Host cells also present viral antigens to the cell surface through both Class I and Class II MHC system for recognition by adaptive immune system. SARS-Cov-2 infection led to the disruption of antigen presentation as demonstrated by higher level of HLA proteins from the flow-through of MHC immunoprecipitation. Glycosylation analysis of HLA proteins from the elution and flow-through of immunoprecipitation revealed that the synthesis and degradation of HLA protein was affected by SARS-Cov-2 infection. This study provided many useful information to study the host response to SARS-Cov-2 infection and would be helpful for the development of therapeutics and vaccine for Covid-19 and future pandemic.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».