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Enregistrement W4293243798 · doi:10.23889/ijpds.v7i3.2097

Development of a Prediction Model for Survival Time in Esophageal Cancer Patients Treated with Resection.

2022· article· en· W4293243798 sur OpenAlexaffabout
Lyndsay D. Harrison, Alyson Mahar, Natalie G. Coburn, Randy Boyes, Michael Pugliese, Carolyn C. Compton, Gail Darling, Laura Davis, Kathleen Decker, Vaibhav Gupta, Biniam Kidane, Douglas G. Manuel, Jolie Ringash, Donna Turner, Amy P. Hsu

Notice bibliographique

RevueInternational Journal for Population Data Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEsophageal Cancer Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of OttawaUniversity of TorontoDalhousie UniversityMcGill UniversityQueen's UniversityUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineStatisticCohortCancer registryStage (stratigraphy)Esophageal cancerClinical trialInternal medicineProportional hazards modelCancerOncologySurgeryStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ObjectiveAccurate estimates of survival guide decision-making for patients and oncologists. Advances in the capacity to measure complex tumour biology and patient factors allow for concurrent consideration of clinical, pathological, molecular, and biological markers for prognostication. Clinical prediction tools are a mechanism to combine and personalize these increasingly large amounts of complex information for prognostication.
 ApproachWe describe the process of linking routinely collected health data, cancer registry, and pathology report data in two provinces to develop (Ontario, Canada) and validate (Manitoba, Canada) a clinical prediction tool in esophageal cancer. We compared the performance of a base model restricted to patient and disease characteristics available prior to surgical resection (e.g., age, sex, histology, comorbidities), and a more complex model including pathology specimen details (e.g., tumour stage). Cox proportional hazards models were fit to predict death at three years following resection. Internal and external validity was assessed using overall calibration and optimism corrected c-statistics. Equity was assessed through calibration in predefined patient subgroups.
 Results2124 patients who underwent surgical resection for esophageal cancer between May 1, 2004 and June 30, 2016 for whom a pathology record was available were included in the study cohort. Median age was 66, with 80% males and 85% adenocarcinomas. Survival data were available until March 31, 2020. The model with pathology data had superior discrimination and calibration (calibration slope of 1.02 and intercept -0.01, and optimism-corrected c-statistic 0.77), compared to the base model (calibration slope of 0.95, intercept 0.02, and c-statistic 0.60). External validation is ongoing.
 ConclusionOur study demonstrates that prediction models for cancer prognosis built solely on data from health administrative databases may be unreliable. The addition of high-quality pathology report data from electronic medical records or population-based cancer registries is necessary for accurate estimation. Our work provides a framework for combining administrative and clinical data which could be applied to the development of other clinical prediction models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,481
Score d'incertitude au seuil0,265

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,396
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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