MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4293246659 · doi:10.1101/2022.05.10.491367

Bcl-xL is a key mediator of apoptosis following KRAS <sup>G12C</sup> inhibition in <i>KRAS</i> <sup> <i>G12C</i> </sup> mutant colorectal cancer

2022· preprint· en· W4293246659 sur OpenAlexfundno aff
Hajrah Khawaja, Rebecca Briggs, Cheryl H. Latimer, Md A.M.B. Rassel, Daryl Griffin, Lyndsey Hanson, Alberto Bardelli, Frederica Di Nicolantonio, Simon S. McDade, Christopher J. Scott, Shauna Lambe, Manisha Maurya, Andreas U. Lindner, Jochen H.M. Prehn, José Sousa, Chris Winnington, Melissa J. LaBonte, Sarah J. Ross, Sandra Van Schaeybroeck

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAstraZenecaQueen's University BelfastQueen's UniversityEuropean CommissionScience Foundation IrelandCancer Research UKHealth Research Board
Mots-clésKRASApoptosisCancer researchColorectal cancerMutantChemistryCancerMedicineInternal medicineBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Purpose Novel covalent inhibitors of KRAS G12C have shown limited response rates in KRAS G12C mutant (MT) colorectal cancer (CRC) patients. Thus, novel KRAS G12C inhibitor combination strategies that can achieve deep and durable responses are needed. Experimental design Small molecule KRAS G12C inhibitors AZ’1569 and AZ’8037 were employed. To identify novel candidate combination strategies for AZ’1569, we performed RNA sequencing, siRNA and high-throughput drug screening. Top hits were validated in a panel of KRAS G12C MT CRC cells and in vivo . AZ’1569-resistant CRC cells were generated and characterised. Results Response to AZ’1569 was heterogeneous across the KRAS G12C MT models. AZ’1569 was ineffective at inducing apoptosis when used as single-agent or combined with chemotherapy or agents targeting the EGFR/KRAS/AKT axis. Using a systems biology approach, we identified the anti-apoptotic BH3-family member BCL2L1 /Bcl-xL as a top hit mediating resistance to AZ’1569. Further analyses identified acute increases in the pro-apoptotic protein BIM following AZ’1569 treatment. ABT-263 (Navitoclax), a pharmacological Bcl-2 family-inhibitor that blocks the ability of Bcl-xL to bind and inhibit BIM, led to dramatic and universal apoptosis when combined with AZ’1569. Furthermore, this combination also resulted in dramatically attenuated tumour growth in KRAS G12C MT xenografts. Finally, AZ’1569-resistant cells showed amplification of KRAS G12C , EphA2/c-MET activation, increased pro-inflammatory chemokine profile and cross-resistance to several targeted agents. Importantly, KRAS amplification and AZ’1569-resistance were reversible upon drug withdrawal, arguing strongly for the use of drug holidays in the case of KRAS amplification. Conclusions Combinatorial targeting of Bcl-xL and KRAS G12C is highly effective, suggesting a novel therapeutic strategy for KRAS G12C MT CRC patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetCell death mechanisms and regulation→Travaux en français237 207→