MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4293274664 · doi:10.1097/pas.0000000000001956

Targeted Mutational Profiling Reveals Clonal Relationships in Metachronous Occurrence of Classic Hodgkin and Mediastinal Large B-Cell Lymphomas

2022· article· en· W4293274664 sur OpenAlexaff
Kunwar Singh, Lhara S. Lezama, Jason H. Kurzer, Jean Oak, Liora M. Schultz, Ann Walkush, Tse-Chang Cheng, Everett H. Chen, William A. May, Cheryl Chang, Michael P. Link, Ranjana H. Advani, Carlos J. Suarez, Yasodha Natkunam

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensPediatric Oncology Group
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLymphomaDiffuse large B-cell lymphomaSomatic evolution in cancerPathologyBiologyCancer researchDiseaseOncologyMedicineInternal medicineCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Classic Hodgkin lymphoma (CHL) patients may infrequently present with a prior or recurrent disease with discordant histology resembling non-Hodgkin lymphomas. These include primary mediastinal large B-cell lymphoma (PMBL), diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), or mediastinal gray-zone lymphoma (MGZL). Such patients are often refractory to standard therapy and their diagnosis is hampered by significant morphologic and immunophenotypic overlap and insufficient molecular data. Among 509 CHL patients seen at an academic medical center, 6 patients had a prior or subsequent diagnosis different from CHL. Paired tissue samples were evaluated by targeted mutational analysis using a 164-gene panel. Our findings show multiple shared variants indicative of a clonal relationship between the CHL and the PMBL, DLBCL, or MGZL diagnoses. Most frequent mutated genes included TNFAIP3 (4 of 6, 66.7%), STAT6 (3 or 6, 50%), ARID1A (3 of 6, 50%), and XPO1 (3 of 5, 60%). Three patients showed the same oncogenic variant within the XPO1 gene (E571K), and mutations in TNFAIP3 and B2M were observed in 2 of the 5 patients with shared variants. In addition, differences in the mutation profile between the lymphoma pairs were also observed, which could represent clonal evolution. Mutational profiling could be of benefit in patients with recurrent/refractory disease with discordant histology, where the clonal relationship could be helpful to inform and guide therapeutic decisions. These findings provide further evidence of a true biological continuum surrounding CHL, PMBL, DLBCL, and MGZL and shed light on underlying genetic events and their clinical impact.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe American Journal of Surgical PathologyMême sujetLymphoma Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207