MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4293508024 · doi:10.1101/2022.08.26.505481

Overlapping local and systemic defense induced by an oomycete fatty acid MAMP and brown seaweed extract in tomato

2022· preprint· en· W4293508024 sur OpenAlexaff
Domonique C. Lewis, Danielle M. Stevens, Holly Little, Gitta Coaker, Richard M. Bostock

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensAcadian Seaplants (Canada)
Organismes subventionnairesGenome Center, University of California, DavisUniversity of California, DavisU.S. Department of AgricultureNational Institute of Food and AgricultureNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésOomyceteJasmonic acidBiologySalicylic acidPlant disease resistanceFatty acidArachidonic acidBotanyOxylipinGeneElicitorEicosapentaenoic acidMicrobiologyBiochemistryPolyunsaturated fatty acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Eicosapolyenoic fatty acids are integral components of oomycete pathogens that can act as microbe-associated molecular patterns (MAMPs) to induce disease resistance in plants. Defense inducing eicosapolyenoic fatty acids include arachidonic (AA) and eicosapentaenoic acids, and are strong elicitors in solanaceous plants with bioactivity in other plant families. Similarly, extracts of the brown seaweed, Ascophyllum nodosum , used in sustainable agriculture as a biostimulant of plant growth, may also induce disease resistance. A. nodosum , similar to other macroalgae, is rich in eicosapolyenoic fatty acids, which comprise as much as 25% of total fatty acid composition. We investigated the response of roots and leaves from AA or a commercial A. nodosum extract (ANE) on root-treated tomatoes via RNA sequencing, phytohormone profiling, and disease assays. AA and ANE significantly altered transcriptional profiles relative to control plants, inducing numerous defense-related genes with both substantial overlap as well as differences in gene expression patterns. Root treatment with AA and, to a lesser extent, ANE also altered both salicylic acid and jasmonic acid levels while inducing local and systemic resistance to oomycete and bacterial pathogen challenge. Thus, our study highlights overlap in both local and systemic defense induced by AA and ANE, with potential for inducing broad-spectrum resistance against pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetPlant-Microbe Interactions and Immunity→Travaux en français237 207→