Dirofilaria immitis: Genotyping Randomly Selected European Clinical Samples and USA Laboratory Isolates with Molecular Markers Associated with Macrocyclic Lactone Susceptibility and Resistance
Notice bibliographique
Résumé
Dirofilaria immitis is a parasitic nematode and causes dirofilariosis, a potentially fatal pulmonary infection which primarily infects canids. Dirofilariosis infections are controlled via prophylactic macrocyclic lactone (ML) regimens. Recent evidence has confirmed the development of ML-resistant isolates in the USA, which are genetically distinct from wildtype populations. Single nucleotide polymorphisms (SNP) associated with ML-resistant phenotypes were clinically validated in USA populations. In this study, 3 USA laboratory-maintained isolates (Berkeley, Georgia II, and WildCat) and 11 randomly selected European clinical samples from 7 hosts were analyzed. The samples tested were fresh microfilaria (mf) in blood or adult worms preserved in ethanol. The samples underwent MiSeq sequencing of the top 9 SNP associated with ML resistance. The results provide the first genotypic analysis of the three USA laboratory-maintained isolates and any European samples. The European clinical samples show no genomic evidence of ML resistance based on the 9 SNP. The early adoption of genotyping of clinical D. immitis samples could provide an early indication of the potential development of ML resistance and aid to distinguish clinical cases of heartworm infection due to ML resistance from those due to a lack compliance with the recommended treatments, as has been seen in North America.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».