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Enregistrement W4293581843 · doi:10.1080/09553002.2022.2117873

International expert group collaboration for developing an adverse outcome pathway for radiation induced leukemia

2022· review· en· W4293581843 sur OpenAlexaff
Dmitry Klokov, Kimberly E. Applegate, Christophe Badie, Dag Anders Brede, Fieke Dekkers, Melis Karabulutoglu, Yevgeniya Le, Eric Andreas Rutten, Katalin Lumniczky, Maria Gomolka

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Radiation Biology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEffects of Radiation Exposure
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNorges ForskningsrådInstitut de Radioprotection et de SÛreté Nucléaire
Mots-clésAdverse Outcome PathwayAdverse effectAllianceSystematic reviewWorking groupMyeloid leukemiaMedicinePsychologyBiologyMEDLINEComputer scienceCancer researchPharmacologyPolitical scienceComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The concept of the adverse outcome pathway (AOP) has recently gained significant attention as to its potential for incorporation of mechanistic biological information into the assessment of adverse health outcomes following ionizing radiation (IR) exposure. This work is an account of the activities of an international expert group formed specifically to develop an AOP for IR-induced leukemia. Group discussions were held during dedicated sessions at the international AOP workshop jointly organized by the MELODI (Multidisciplinary European Low Dose Initiative) and the ALLIANCE (European Radioecology Alliance) associations to consolidate knowledge into a number of biological key events causally linked by key event relationships and connecting a molecular initiating event with the adverse outcome. Further knowledge review to generate a weight of evidence support for the Key Event Relationships (KERs) was undertaken using a systematic review approach. CONCLUSIONS: An AOP for IR-induced acute myeloid leukemia was proposed and submitted for review to the OECD-curated AOP-wiki (aopwiki.org). The systematic review identified over 500 studies that link IR, as a stressor, to leukemia, as an adverse outcome. Knowledge gap identification, although requiring a substantial effort via systematic review of literature, appears to be one of the major added values of the AOP concept. Further work, both within this leukemia AOP working group and other similar working groups, is warranted and is anticipated to produce highly demanded products for the radiation protection research community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,157
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,239
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,157
Score d'incertitude au seuil0,829

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1570,239
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,010
Bibliométrie0,0210,014
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0060,005
Science ouverte0,0050,010
Intégrité de la recherche0,0060,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0160,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,435
Écart entre enseignants0,351 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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