MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4293796027 · doi:10.21203/rs.3.rs-1979649/v1

In-Silico Study of Asymmetric Remodeling of Tumors in Response to External Biochemical Stimuli

2022· preprint· en· W4293796027 sur OpenAlexafffund
Meitham Amereh, Mohsen Akbari, Ben Nadler

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesBC Cancer Foundation
Mots-clésContext (archaeology)Tumor microenvironmentIn silicoCell biologyBiologyHomeostasisTissue remodelingBiophysicsCancer researchTumor cellsInflammationBiochemistryImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Among different hallmarks of cancer, understanding biomechanics of tumor growth and remodeling benefits the most from the theoretical framework of continuum mechanics. Tumor remodeling initiates when cancer cells seek new homeostasis in response to the microenvironmental stimuli. Cells within a growing tumor are capable to remodel their inter- and intraconnections and become more mobile to achieve a new homeostasis. This mobility enables the tumor to undergo large deformation. In this work, we studied the remodeling in the context of continuum mechanics. We developed an evolution law for the remodeling-associated deformation which correlates the remodeling to a characteristic tensor of external stimuli. The asymmetric remodeling and the induced mechanical stresses were analyzed for different types of biochemical distributions. To experimentally investigate the model, we studied the remodeling of human glioblastoma (hGB) tumoroids in response to the gradient of nutrients. Using a tumoroid-on-a-chip platform, the degree of remodeling was estimated for the ellipsoidal tumoroids over time. It was observed that higher gradient of nutrients induces higher degree of ellipticity suggesting that the gradient of nutrient is a characteristic property of nutrient distribution that derives the remodeling. We also showed that remodeling gives rise to heterogeneity in cell distribution forming circumstantially aligned cells within the tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,418
Écart entre enseignants0,357 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueResearch SquareMême sujetCellular Mechanics and InteractionsTravaux en français237 207