MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4293825639 · doi:10.21203/rs.3.rs-1933628/v1

Clear Cell Carcinoma of Uterine Cervix: A Clinicopathologic Review and Molecular Characterization

2022· review· en· W4293825639 sur OpenAlexaff
Sara Pakbaz, Nikki Esfahanian, Sanaz Sanii, Blaise Clarke, Marcus Q. Bernardini, Kathy Han, Stéphanie Lheureux, Nicole Park, Tracy Stockley, Marjan Rouzbahman

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOvarian cancer diagnosis and treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUterine cervixCarcinomaCervixCharacterization (materials science)MedicineGynecologyPathologyInternal medicineCancerMaterials scienceNanotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Clear cell carcinoma of uterine cervix (CCCUC) is an uncommon variant of cervical adenocarcinoma unrelated to Human Papilloma Virus (HPV). With widespread Pap test screening and HPV vaccination resulting decline in incidence of cervical HPV-related cancers, it is important to develop better understanding of the less common HPV-independent variants of cervical adenocarcinoma, including CCCUC. In this study, 10 cases of CCCUCs diagnosed over a 15 year period were retrospectively reviewed for clinicopathological and immunohistochemistry characteristics and HPV DNA PCR; and next generation sequencing (NGS) was performed in cases with available pathology material. Mean age of patients was 39.6 (range of 18–82) and all presented with vaginal bleeding. Most cases (6/10) were diagnosed at FIGO stage IIB. Eight patients had surgery, with lymph nodes dissection in 7. Adjuvant therapy followed in 5 cases. Median follow up period was 38 months. HPV DNA PCR proved negative HPV status in all cases. For immunohistochemistry, all cases showed wild-type p53 expression, positive PAX8 and HNF1β, and negative ER and PR. MMR protein expression was intact in 4 cases. Two cases had lost/equivocal MSH2/MSH6 expression, one of which proved negative for microsatellite instability in NGS. Based on combined positive score (CPS), more than half of cases with available PD-L1 (4/7) were positive. 70 genetic variants were identified in testing of tumor tissue DNA from 6 cases with an NGS panel assessing 562 cancer-associated genes for single-nucleotide and copy-number variations for selected genes, and insertions/deletions. Variants occurred most frequently in genes ATM, CDH23, CSMD3, KDM5C, LRP1B, NIN, PKHD1, and RNF213. Pathways that were enriched for genes in this data set include apoptosis regulation, cell cycle and DNA repair, PI3K-AKT signaling, and NGF signaling. Multiple genes were associated with receptor tyrosine kinase activity, chromatin remodeling, and transcriptional regulation. This is the first study to explore the genomic landscape of CCCUC using Next Generation Sequencing. Some potentially actionable molecular alterations are present in these tumors. However, genetic findings are heterogeneous and further studies with larger sample size is required to better characterize this rare malignancy and to allow development of novel diagnostic and therapeutic techniques.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,149
Tête enseignante GPT0,467
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueResearch Square→Même sujetOvarian cancer diagnosis and treatment→Travaux en français237 207→