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Enregistrement W4294073980 · doi:10.1038/s41398-022-02136-0

Microstructural imaging and transcriptomics of the basal forebrain in first-episode psychosis

2022· article· en· W4294073980 sur OpenAlexafffund
Min Tae M Park, Peter Jeon, Leon French, Kara Dempster, M. Mallar Chakravarty, Michael Mackinley, Julie Richard, Ali R. Khan, Jean Théberge, Lena Palaniyappan

Notice bibliographique

RevueTranslational Psychiatry · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensRobarts Clinical TrialsDouglas Mental Health University InstituteMcGill UniversityDouglas CollegeDalhousie UniversityUniversity of TorontoLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoGovernment of CanadaCanada First Research Excellence FundGovernment of OntarioCompute CanadaAcademic Medical Organization of Southwestern OntarioMcGill UniversityChrysalis
Mots-clésPsychosisBasal forebrainNucleus basalisMyelinCholinergicNeurosciencePsychologySchizophrenia (object-oriented programming)Cholinergic neuronInternal medicineMedicinePsychiatryCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cholinergic dysfunction has been implicated in the pathophysiology of psychosis and psychiatric disorders such as schizophrenia, depression, and bipolar disorder. The basal forebrain (BF) cholinergic nuclei, defined as cholinergic cell groups Ch1-3 and Ch4 (Nucleus Basalis of Meynert; NBM), provide extensive cholinergic projections to the rest of the brain. Here, we examined microstructural neuroimaging measures of the cholinergic nuclei in patients with untreated psychosis (~31 weeks of psychosis, <2 defined daily dose of antipsychotics) and used magnetic resonance spectroscopy (MRS) and transcriptomic data to support our findings. We used a cytoarchitectonic atlas of the BF to map the nuclei and obtained measures of myelin (quantitative T1, or qT1 as myelin surrogate) and microstructure (axial diffusion; AxD). In a clinical sample (n = 85; 29 healthy controls, 56 first-episode psychosis), we found significant correlations between qT1 of Ch1-3, left NBM and MRS-based dorsal anterior cingulate choline in healthy controls while this relationship was disrupted in FEP (p > 0.05). Case-control differences in qT1 and AxD were observed in the Ch1-3, with increased qT1 (reflecting reduced myelin content) and AxD (reflecting reduced axonal integrity). We found clinical correlates between left NBM qT1 with manic symptom severity, and AxD with negative symptom burden in FEP. Intracortical and subcortical myelin maps were derived and correlated with BF myelin. BF-cortical and BF-subcortical myelin correlations demonstrate known projection patterns from the BF. Using data from the Allen Human Brain Atlas, cholinergic nuclei showed significant enrichment for schizophrenia and depression-related genes. Cell-type specific enrichment indicated enrichment for cholinergic neuron markers as expected. Further relating the neuroimaging correlations to transcriptomics demonstrated links with cholinergic receptor genes and cell type markers of oligodendrocytes and cholinergic neurons, providing biological validity to the measures. These results provide genetic, neuroimaging, and clinical evidence for cholinergic dysfunction in schizophrenia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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