Clinical impact of functional CYP2C19 and CYP2D6 gene variants on treatment outcomes in patients with depression: a Danish cohort study
Notice bibliographique
Résumé
Introduction Pharmacogenetic (PGx) targets to optimize drug therapy, but its implementation is rare. Objectives We evaluate the clinical utility of PGx testing in psychiatry by investigating the one-year risks of clinical outcomes in patients with depression taking sertraline, (es)citalopram or fluoxetine by their Cytochrome P450 (CYP) 2C19/2D6 phenotypes. Methods We investigated 17,297 individuals born between 1981-2005 with a depression diagnosis between 1996-2012 from the iPsych2012 case-cohort. Based on array-based single-nucleotide-polymorphism genotype data, individuals were phenotyped as CYP2C19/CYP2D6 normal (NM, reference group), ultra-rapid- (UM), rapid- (RM), intermediate- (IM), or poor-metabolizer (PM). Outcomes were treatment switching or discontinuation, psychiatric in-, out-, and emergency room contacts (ER), and suicide attempt/self-harm. Incidence rate ratios (IRR) by age groups were estimated using Poisson regression analysis with 95% confidence intervals, adjusted for potential confounders. Results Risks of switching (IRR=1.89[1.22-2.93]), ERs (1.69 [1.01-2.81]) and suicide attempt/self-harm (2.73 [1.49-5.01]) were higher in CYP2C19 PMs <19 years taking (es)citalopram. Fluoxetine users <19 years had a decreased risk of discontinuation in CYP2D6 PMs (0.5 [0.27-0.95]) and decreased risk of out-patient contacts in CYP2D6 PMs and IMs (IRRIM=0.83 [0.68-1.00] and IRRPM=0.59 [ 0.37-0.96]). We observed an increased risk for ERs in CYP2D6 PMs aged 19-25 years taking fluoxetine (4.53 [1.54-13.35]). In CYP2C19 UMs >25 years taking (es)citalopram the risk of suicide attempt/self-harm was more than three-fold increased (3.64 [ 1.01-13.19]). We found no significant results in users of sertraline. Conclusions PGx variability was associated with treatment outcomes in depression in patients with CYP2C19 PM or UM status taking (es)citalopram, or CYP2D6 PM or IM status taking fluoxetine. Disclosure No significant relationships.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».