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Enregistrement W4294307483 · doi:10.1101/2022.08.29.505768

Evolution of an extreme hemoglobin phenotype contributed to the sub-Arctic specialization of extinct Steller’s sea cows

2022· preprint· en· W4294307483 sur OpenAlexafffund
Anthony V. Signore, Phillip R. Morrison, Colin J. Brauner, Angela Fago, Roy E. Weber, Kevin L. Campbell

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNaturvidenskab og Teknologi, Aarhus UniversitetNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDanmarks Frie ForskningsfondAarhus Universitet
Mots-clésPhenotypeBiologyAllosteric regulationAmino acidHemoglobinZoologyGeneEvolutionary biologyGeneticsBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The extinct Steller’s sea cow ( Hydrodamalis gigas ; †1768) was a whale-sized marine mammal that manifested profound morphological specializations to exploit the harsh coastal climate of the North Pacific. Yet despite first-hand accounts of their biology, little is known regarding the physiological adjustments underlying their evolution to this environment. Here, the adult-expressed hemoglobin (Hb; α 2 β/δ 2 ) of this sirenian is shown to harbor a fixed amino acid replacement at an otherwise invariant position (β/δ82Lys→Asn) that alters multiple aspects of Hb function. First, our functional characterization of recombinant sirenian Hb proteins demonstrate that the Hb–O 2 affinity of this sub-Arctic species was less affected by temperature than those of living (sub)tropical sea cows. This phenotype presumably safeguarded O 2 delivery to cool peripheral tissues and largely arises from a reduced intrinsic temperature sensitivity of the H. gigas protein. Additional experiments on H. gigas β/δ82Asn→Lys mutant Hb further reveal this exchange renders Steller’s sea cow Hb unresponsive to the potent intraerythrocytic allosteric effector 2,3-diphosphoglycerate, a radical modification that is the first documented example of this phenotype among mammals. Notably, β/δ82Lys→Asn moreover underlies the secondary evolution of a reduced blood–O 2 affinity phenotype that would have promoted heightened tissue and maternal/fetal O 2 delivery. This conclusion is bolstered by analyses of two Steller’s sea cow prenatal Hb proteins (Hb Gower I; ζ 2 ε 2 and HbF; α 2 γ 2 ) that suggest an exclusive embryonic stage expression pattern, and reveal uncommon replacements in H. gigas HbF (γ38Thr→Ile and γ101Glu→Asp) that increased Hb–O 2 affinity relative to dugong HbF. Finally, the β/δ82Lys→Asn replacement of the adult/fetal protein is shown to increase protein solubility, which may have elevated red blood cell Hb content within both the adult and fetal circulations and contributed to meeting the elevated metabolic (thermoregulatory) requirements and fetal growth rates associated with this species cold adaptation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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