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Enregistrement W4294335516 · doi:10.1101/2022.08.31.22279265

Deep immune profiling uncovers novel associations with clinical phenotypes of Multisystem Inflammatory Syndrome in Children (MIS-C)

2022· preprint· en· W4294335516 sur OpenAlexaff
Christopher Redmond, Moses M. Kitakule, Aran Son, McKella Sylvester, Keith Sacco, Ottavia M. Delmonte, Francesco Licciardi, Riccardo Castagnoli, Cecilia Poli, Yasmin Espinoza, Camila Astudillo, Sarah Weber, Gina A. Montealegre Sanchez, Karyl S. Barron, Mary Magliocco, Kerry Dobbs, Yu Zhang, Helen Matthews, Cihan Oguz, Helen C. Su, Luigi D. Notarangelo, Pamela A. Frischmeyer‐Guerrerio, Daniella M. Schwartz

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueKawasaki Disease and Coronary Complications
Établissements canadiensColumbia College
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthClínica Alemana de SantiagoHadassah Medical OrganizationNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesFondazione IRCCS Policlinico San MatteoUniversità degli Studi di Napoli Federico II
Mots-clésPhenotypeProfiling (computer programming)Immune systemClinical phenotypeImmunologyMedicineBiologyComputational biologyBioinformaticsGeneticsComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Multisystem Inflammatory Syndrome in Children (MIS-C) is a systemic inflammatory condition that follows SARS-CoV2 infection or exposure in children. Clinical presentations are highly variable and include fever, gastrointestinal (GI) disease, shock, and Kawasaki Disease-like illness (MIS-C/KD). Compared to patients with acute COVID, patients with MIS-C have a distinct immune signature and expansion of TRVB11 expressing T cells. However, the relationship between immunological and clinical phenotypes of MIS-C is unknown. Here, we measured serum biomarkers, TCR repertoire, and SARS-CoV2-specific T cell responses in a cohort of 76 MIS-C patients. Serum biomarkers associated with macrophage and Th1 activation were elevated in patients with shock, consistent with previous reports. Significantly increased SARS-CoV-2-induced IFN-γ, IL-2, and TNF-α production were seen in CD4 + T cells from patients with neurologic involvement and respiratory failure. Diarrhea was associated with a significant reduction in shock-associated serum biomarkers, suggesting a protective effect. TRVB11 usage was highly associated with MIS-C/KD and coronary aneurysms, suggesting a potential biomarker for these manifestations in MIS-C patients. By identifying novel immunologic associations with the different clinical phenotypes of MIS-C, this study provides insights into the clinical heterogeneity of MIS-C. These unique immunophenotypic associations could provide biomarkers to identify patients at risk for severe complications of MIS-C, including shock and MIS-C/KD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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